基于GSS高通量测序技术的怀山药根、茎中内生真菌群落多样性分析

• 作者: 刘元 文春南 文晴 李守婷 申进文 阮元 麻兵继
• 来源期刊: 浙江农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 怀山药 内生真菌 GSS高通量测序 内生真菌多样性
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 药用植物
• 页码范围: 64-68
• 页数: 5页
• 分类号: S567
• 字数: 3757字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16178/j.issn.0528-9017.20180125

摘要

采用GSS高通量测序技术分别测定怀山药根和茎中内生真菌的内转录间隔区ITS序列,将真菌归类到种或亚种水平.用Qiime和Mothur等软件分析样品的序列数目和操作单元数量,进而分析物种的丰度和Alpha多样性.本试验从怀山药根和茎分别获得的有效序列数为64774条和273930条;根、 茎OTU数分别为268、308.其中根部内生真菌含5门,14纲,36目,65科,92属,109种;茎部内生真菌包含4门,14纲,38目,66科,95属,112种.结果表明,怀山药根、 茎中内生真菌非常丰富,且茎中内生真菌多样性程度略高于根.根的优势菌群为葡萄孢盘菌属(Botryotinia),茎的优势菌群为链格孢属(Alternaria).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	麻兵继	河南农业大学中药材系	45	291	10.0	15.0
2	申进文	河南农业大学生物系	85	534	12.0	18.0
3	阮元	河南农业大学中药材系	22	168	8.0	12.0
4	文春南	河南农业大学中药材系	11	51	4.0	7.0
5	文晴	河南农业大学生物系	15	42	3.0	6.0
6	李守婷	河南农业大学中药材系	6	24	3.0	4.0
7	刘元	河南农业大学中药材系	6	8	2.0	2.0