苋菜amaARF6基因克隆及其外源激素处理下在幼苗中响应分析

• 作者: 刘生财 张梓浩 彭丽云 潘君飞 王晓 赖钟雄 赵春丽 陈裕坤
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苋菜 amaARF6 生物信息学分析 外源激素 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 页码范围: 24-32
• 页数: 9页
• 分类号: S636.4
• 字数: 4554字
• 语种: 中文

摘要

以‘大红’苋菜(Amaranthus tricolor L.‘Dahong’)为材料,根据实验室构建的苋菜转录组数据库(SRA:SSR924089～SSR924092),采用RT-PCR结合RACE技术克隆获得1条生长素响应因子ARF6基因cDNA全长序列,命名为amaARF6(登录号为MG581459).苋菜amaARF6基因cDNA全长3 758 bp,含一个2 697 bp开放阅读框,编码898个氨基酸.生物信息学分析表明,amaARF6包括生长素响应因子结构域和生长素功能位点,有ARF基因家族特有序列特征;系统进化树分析发现,amaARF6蛋白与同为石竹目甜菜BvARF6蛋白进化距离最近,相似度高达100％.荧光定量PCR分析表明,苋菜幼苗在不同浓度2,4-D、IAA、IBA等生长素及不同浓度GA3和PP333处理下,amaARF6基因均受调控,且在2,4-D、IAA、IBA等生长素处理后表达上调,经GA3和PP333处理后表达下调.研究还发现,苋菜中甜菜红素累积受GA3和2,4-D抑制,PP333促进甜菜红素合成,amaARF6基因表达量在GA3和PP333处理下呈相反变化趋势.研究结果表明,amaARF6基因可能具备ARF家族正调控因子表达特征和功能,可能参与调控苋菜幼苗生长和甜菜红素合成.研究结果为揭示amaARF6基因在苋菜幼苗生长中作用奠定基础,为苋菜育种提供线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	陈裕坤	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	48	97	5.0	7.0
3	张梓浩	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	37	72	5.0	5.0
4	王晓	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	18	18	3.0	3.0
5	赵春丽	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	9	17	4.0	4.0
6	彭丽云	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	12	14	3.0	3.0
7	潘君飞	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	7	18	3.0	4.0