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紫花苜蓿CAX基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应分析
紫花苜蓿CAX基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应分析
作者:
张国香
郭卫冷
毕铭钰
张力爽
王丹
郭长虹
原文服务方:
草业学报
紫花苜蓿
CAX 基因家族
全基因组
非生物胁迫
基因表达
摘要:
Ca2+/H+反向转运蛋白(CAX)是一类重要的跨膜转运蛋白,在调控植物Ca2+平衡、抵抗非生物胁迫和转运重金属离子等方面具有重要作用。利用生物信息学方法在全基因组水平对紫花苜蓿CAX基因家族进行了鉴定,并对其理化性质、结构特征、系统进化关系、顺式作用元件、染色体定位等进行了分析。结果表明,在紫花苜蓿全基因组中共筛选鉴定出15个MsCAX基因,分布于紫花苜蓿15条染色体上,发生22对基因片段重复事件,编码367~460个氨基酸,等电点为5.2~6.5,且均表现为疏水性蛋白。系统进化关系分析结果表明,MsCAXs分为2个亚家族,同一亚家族成员具有相似的基因结构、保守基序和跨膜结构域数量。MsCAXs启动子区域存在光响应性、激素反应性和胁迫响应元件。利用qRT-PCR分析了6个MsCAXs基因在非生物胁迫下的表达模式,结果表明,在干旱和低温胁迫下,6个MsCAX基因均显著下调表达,在盐和盐碱胁迫下,3个MsCAX基因上调表达。说明在不同的非生物胁迫下,MsCAXs基因表现出不同的表达模式。研究结果为进一步探索紫花苜蓿CAX基因家族的功能提供了参考。
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文献信息
篇名
紫花苜蓿CAX基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应分析
来源期刊
草业学报
学科
关键词
紫花苜蓿
CAX 基因家族
全基因组
非生物胁迫
基因表达
年,卷(期)
2022,(12)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
106-117
页数
11页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10. 11686/cyxb2021471
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
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2022(0)
参考文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
紫花苜蓿
CAX 基因家族
全基因组
非生物胁迫
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
草业学报
主办单位:
中国草学会和兰州大学共同主办
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-5759
CN:
62-1105/S
开本:
出版地:
兰州市嘉峪关西路768号
邮发代号:
创刊时间:
1990-01-01
语种:
中文
出版文献量(篇)
145
总下载数(次)
0
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