基于全基因组水平的维吾尔族多囊卵巢综合征患者卵巢组织的特异性甲基化谱改变

• 作者: 万迎香 朱金虎 杨琇玮 毛婷 洪小山
• 来源期刊: 中华妇幼临床医学杂志（电子版）
• 关键词: 多囊卵巢综合征 DNA甲基化 免疫沉淀法 CpG岛 卵巢 基因组 转录启动子 女(雌)性
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 683-690
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3877/cma.j.issn.1673-5250.2018.06.010

摘要

目的 在全基因组水平上,探讨维吾尔族多囊卵巢综合征(PCOS)患者卵巢组织的特异性甲基化谱改变.方法 选择2014年5月至2016年6月,于喀什地区第一人民医院进行诊治的60例维吾尔族PCOS患者的卵巢组织(PCOS组)及60例维吾尔族卵巢囊肿患者的正常卵巢组织(对照组)为研究对象.采用甲基化DNA免疫共沉淀结合芯片(MeDIP-chip)技术,对2组卵巢组织的基因组DNA进行全基因组胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)岛和启动子区域甲基化扫描.将MeDIP-chip结果中,峰值得分≥2的区域,判定为阳性甲基化区域,以筛选甲基化基因;对PCOS卵巢组织峰值得分≥5的特异性高甲基化基因,进行基因本体(G())分析及Pathway分析,以探讨这些特异性高甲基化基因对机体相关功能的影响.对2组卵巢组织的甲基化谱差异,采用配对t检验及x 2检验进行统计学比较.本研究遵循的程序符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》的要求,所有受试者均自愿参加本研究,并签署知情同意书.结果 ①MeDIP-chip结果显示:PCOS组全基因组CpG岛和启动子的甲基化率,分别为12.9％(3 633/28 226)和3.8％(687/18 028),对照组分别为13.3％(3 759/28 226)和3.6％(643/18 028).2组卵巢组织全基因组整体甲基化水平,以及甲基化片段在基因组各区的分布比较,差异均无统计学意义(P＞0.05).②2组卵巢组织全基因组转录调控区的上游调控区和核心启动子区域甲基化水平比较,差异均无统计学意义(P＞0.05).PCOS组转录调控区的基因编码区甲基化水平为(3.14±0.21),显著低于对照组的(3.96±0.23),并且差异有统计学意义(t=2.653,P=0.010).③2组卵巢组织全基因组高甲基化启动子的高-CpG含量启动子(HCP)、中-CpG含量启动子(ICP)及低-CpG含量启动子(LCP)的分布比较,差异有统计学意义(x2=3.208,P=0.002),其中PCOS组卵巢组织全基因组HCP比例最高(40.1％),对照组HCP比例则最低(13.3％).PCOS组卵巢组织全基因组HCP甲基化水平为(0.68±0.08),低于对照组的(0.71±0.09),而ICP及LCP甲基化水平分别为(0.74±0.13)和(0.76±0.11),则高于对照组的(0.61±0.07)和(0.32±0.03),并且差异均有统计学意义(t=1.686,P=0.049;t=1.992,P=0.028;t=3.361,P=0.002).④GO分析及Pathway分析结果显示:维吾尔族PCOS患者卵巢组织的特异性高甲基化基因,主要参与受体结合、蛋白质结合、激素活性、转录调节活性、转录因子活性和DNA结合等过程.结论 维吾尔族PCOS患者卵巢组织的基因编码区甲基化水平,较正常卵巢组织低;全基因组高甲基化启动子的HCP比例最高,但是甲基化水平较正常卵巢组织的低,ICP及LCP的甲基化水平,较正常卵巢组织的高.这些特异性甲基化改变,可能与维吾尔族女性的PCOS发生、发展有关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	毛婷	广东省妇幼保健院妇科	8	23	2.0	4.0
2	洪小山	广东省妇幼保健院妇科	15	85	6.0	9.0
3	万迎香	喀什地区第一人民医院妇科	3	2	1.0	1.0
4	朱金虎	广东省妇幼保健院妇科	4	15	2.0	3.0
5	杨琇玮	喀什地区第一人民医院妇科	1	0	0.0	0.0