伤寒沙门菌非编码RNA AsfD的分子鉴定及表达特性

• 作者: 刘锐 孙嘉遥 种晓丹 赵昕 陆仁飞 黄新祥
• 来源期刊: 江苏大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 伤寒沙门菌 非编码RNA AsfD 环境应激
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 检验医学
• 页码范围: 232-236
• 页数: 5页
• 分类号: R378.22
• 字数: 2561字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13312/j.issn.1671-7783.y180054

摘要

目的:对伤寒沙门菌flhDC基因对侧编码的疑似非编码RNA AsfD进行分子鉴定及表达特性分析.方法:在AsfD已知序列区设计特异性引物,体外转录制备RNA探针,通过RNA印迹检测伤寒沙门菌AsfD的表达;使用cDNA末端快速扩增(5'rapid amplification of cDNA ends,RACE)和RT-PCR分析AsfD的转录起始位点和终止区域;用qRT-PCR检测AsfD在伤寒沙门菌不同生长时相和环境应激下的表达特性.结果:RNA印迹结果表明,伤寒沙门菌中确实存在AsfD表达,长度在2300 nt左右;5'RACE分析表明,AsfD转录起始点位于flhC基因终止密码子下游590 bp;RT-PCR结果表明其转录终止区域位于flhD基因起始密码子上游558~788 bp之间;序列分析显示AsfD全区域没有明显的ORF结构;qRT-PCR结果显示,AsfD在伤寒沙门菌生长的稳态期表达较高,酸、氧和高渗环境应激后均明显下降(P<0.01).结论:AsfD为伤寒沙门菌一长链非编码RNA,在不同时相和应激条件下存在表达调节.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵昕	江苏大学医学院	9	15	2.0	3.0
2	黄新祥	江苏大学医学院	57	333	5.0	17.0
3	陆仁飞	江苏大学医学院	5	4	1.0	1.0
4	孙嘉遥	江苏大学医学院	2	1	1.0	1.0
5	刘锐	江苏大学医学院	4	4	2.0	2.0
6	种晓丹	海军军医大学转化医学研究院肿瘤研究所	1	0	0.0	0.0