猪丁型冠状病毒的分离鉴定与基因分析

• 作者: 刘怀东 刘灿 孙晓林 孙淼 才学鹏 薛青红 赵炜 陈瑞 魏春霞
• 来源期刊: 中国兽药杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 猪丁型冠状病毒 分离鉴定 腹泻 基因分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 微生物与免疫
• 页码范围: 18-23
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 字数: 2774字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11751/ISSN.1002-1280.2018.05.03

摘要

对山东省某养殖场的腹泻病料进行检测,确认为猪丁型冠状病毒(PDCoV)阳性.使用ST细胞分离到一株PDCoV,命名为SD株.全基因序列测定以及与GenBank中其他68株PDCoV全基因序列比对分析以及遗传进化分析结果表明:PDCoV SD株的全基因组(不包括3'poly(A)尾)序列长度为25414个核苷酸(nt),与参考株HKU15-155、CH/Sichuan/S27/2012和CH-HB-2014的核苷酸同源性分别为98.97％、99.06％和99.13％;此外,在nsp2区的1739～1744位(对应于HKU15-44序列)中的6 nt(TTTGAA)缺失和nsp3区的2810～2818位的9 nt(TCGGCAATG)缺失为特征性基因突变;69株PDCoV呈现出明显的地域特征,其中美国与韩国的PDCoV毒株为一个大分支,越南与泰国PDCoV毒株为另一个小分支,中国的23株PDCoV则呈现出4个小分支,充分展现了该病毒的基因多样性.试验可为中国PDCoV的流行病学和诊断研究以及进一步的疫苗开发提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛青红		21	134	6.0	11.0
2	孙晓林		45	108	5.0	8.0
3	才学鹏		17	35	3.0	4.0
4	孙淼		9	9	2.0	2.0
5	赵炜		3	5	2.0	2.0
6	刘怀东		2	3	1.0	1.0
10	魏春霞		1	3	1.0	1.0