尼罗罗非鱼肠道及养殖环境中菌群结构与链球菌病的相关性

• 作者: 刘志刚 卢迈新 可小丽 张德锋 王淼
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 尼罗罗非鱼 链球菌病 肠道微生物 环境微生物 16S rDNA高通量测序
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 页码范围: 1635-1647
• 页数: 13页
• 分类号: S941.42
• 字数: 8941字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20170910951

摘要

为研究尼罗罗非鱼肠道和池塘养殖环境中菌群结构变化与链球菌病暴发的相关性,实验采用16S rDNA高通量测序方法对比分析发病和健康池塘水体、底泥和尼罗罗非鱼肠道菌群的结构特征.结果显示,底泥中微生物多样性最高,水体和肠道中微生物多样性次之;肠道菌群与水体中菌群的相似性较高,而与底泥中菌群相似性较低;发病组的尼罗罗非鱼肠道和池塘底泥中微生物的多样性均低于健康组,而发病组池塘水体中微生物多样性高于健康组.OTU聚类分析发现,发病与健康尼罗罗非鱼肠道微生物差异极显著,大部分健康尼罗罗非鱼肠道微生物样品单独聚为一支.菌群结构组成分析结果表明,虽然发病组和健康组水体或底泥中优势菌群结构组成的差异较小,但在非优势菌群中存在一定差异,发病组水体中变形菌门和梭杆菌门的比例显著高于健康组水体,疣微菌门和浮霉菌门的丰度显著低于健康组水体;发病组池塘底泥中厌氧粘细菌属、甲烷丝菌属和枝芽孢菌属等具有降解有机质和生态修复功能,菌群的丰度显著低于健康组底泥,而具有致病能力的曼氏杆菌属丰度却显著高于健康组底泥.发病组尼罗罗非鱼肠道菌群中链球菌属、分枝杆菌属和曼氏杆菌属等致病菌群的丰度显著高于健康组尼罗罗非鱼肠道,而乳球菌属、鲸杆菌属和红球菌属等益生菌的丰度显著低于健康尼罗罗非鱼肠道.无乳链球菌普遍存在于发病和健康养殖环境,以及尼罗罗非鱼肠道中,无乳链球菌的丰度在发病和健康养殖环境之间无显著差异,但其在发病尼罗罗非鱼肠道中的丰度要显著高于健康组.研究表明,尼罗罗非鱼链球菌病发病池塘水体和底泥中有益菌丰度降低和致病菌丰度的升高反映其养殖环境出现恶化,尼罗罗非鱼链球菌病的暴发与肠道微生态平衡破坏后无乳链球菌丰度增加密切相关,但肠道中无乳链球菌丰度的剧增与养殖水体和底泥中该病原菌的丰度水平之间并无直接关联.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卢迈新	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	78	1111	19.0	31.0
2	可小丽	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	9	81	6.0	9.0
3	刘志刚	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	14	71	4.0	8.0
4	张德锋		3	12	1.0	3.0
5	王淼	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	9	34	4.0	5.0