伊犁马COMT基因第1外显子多态性及其与心率的关联性

• 作者: 姚新奎 孟军 曾亚琦 王建文 王菊花 辛雅莉
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 伊犁马 COMT基因 遗传多态性 心率
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 页码范围: 1144-1153
• 页数: 10页
• 分类号: S821.2
• 字数: 5756字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2018.06.018

摘要

[目的]研究伊犁马COMT基因第1外显子的多态性及其构建的单倍型,并分析不同基因型、单倍型组合与心率之间的关联程度,为研究COMT基因对马匹气质及生产性能的影响奠定前期基础.[方法]以35匹伊犁马为研究对象,采用酚—氯仿法、DNA测序等技术分析COMT第1外显子基因多态性位点及基因型,通过haploview 4.2软件构建单倍型,采集马匹心率,并对其与不同基因型、单倍型组合进行关联分析.[结果]伊犁马COMT基因第1外显子中共发现8个突变位点,其中SNP1、SNP2、SNP4、SNP5、SNP7和SNP8为错意突变;除SNP7与其余各突变间均无较强连锁外,SNP1-6、SNP8均存在一定的强连锁关系,SNP1和SNP4完全连锁;构建出9种单倍型,其中H1为优势单倍型;进行不同SNPs位点及单倍型组合与心率的关联分析发现SNP3和SNP5不同基因型在温和刺激心率上存在显著或极显著性差异(P＜0.01或P＜0.05),SNP2、SNP5、SNP6、SNP7和SNP8不同基因型在剧烈刺激心率上均有显著或极显著性差异(P＜0.01或P＜0.05),单倍型组合H1H2在剧烈刺激心率上显著性大于H1H3.[结论]伊犁马COMT第1外显子上存在多态性,且不同突变间存在一定程度的强连锁,不同基因型、单倍型组合个体在心率上存在差异,提示COMT基因可能是对伊犁马气质和生产性能影响的重要功能基因.