伊犁马ACTN3基因外显子多态性研究

• 作者: 姚新奎 孟军 曾亚琦 李林玲 王建文 王镜力 辛雅莉
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 伊犁马 ACTN3基因 遗传多态性 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1299-1306
• 页数: 8页
• 分类号: S821.2
• 字数: 3907字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2018.06.023

摘要

旨在鉴定新疆伊犁马 ACTN3基因外显子多态位点及其单倍型,分析不同单倍型对mRNA表达量和蛋白质结构的影响,为进一步探究其基因型与运动性能的关联奠定基础.以38匹伊犁马为研究对象,通过直接测序法筛选 ACTN3基因多态性位点并进行基因型分析,并通过 haploview 4.2 软件进行单倍型分析;利用在线软件(RNAfold和sopm)进行生物信息学分析.结果表明,在伊犁马 ACTN3基因的外显子中共发现了8个多态位点,其中T9059G为错义突变,其余均为同义突变;A6206G和A11517G之间存在强的连锁,其余各突变间也存在一定程度的连锁关系;构建出的14种单倍型中,单倍型 H1(GGATCCCG)为优势单倍型,各单倍型使得 ACTN3基因mRNA二级结构和最小自由能发生改变,且T9059G使得蛋白质二级结构改变.结果提示,T9059G突变位点影响ACTN3蛋白质的二级结构,可能是对伊犁马运动性能产生影响的重要功能位点.