维甲酸诱导腭裂小鼠的舌组织基因芯片筛选和差异基因生物学信息的初步探讨

• 作者: 丛蔚 刘波 王媛媛 肖晶 蒋玉玲
• 来源期刊: 临床口腔医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 维甲酸 腭裂 基因芯片 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 459-464
• 页数: 6页
• 分类号: R782
• 字数: 4983字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-1634.2018.08.004

摘要

目的:利用基因芯片技术筛选维甲酸腭裂小鼠舌组织相关的差异基因,确定其功能及相关信号通路,并观察差异表达基因在维甲酸诱导腭裂小鼠形成中基因表达变化的调控模式及其生物学意义.方法:建立维甲酸诱导的腭裂小鼠模型,在ICR系小鼠怀孕第10 d管饲浓度为100 mg/kg全反式维甲酸,获取胚胎13.5 d的实验组和对照组小鼠舌组织,进行Affymetrix Mouse 4302.0表达谱芯片实验,获得维甲酸腭裂小鼠的舌组织的异常表达基因,进而结合GO分类功能分析差异基因功能.通过Biocarta及Kegg信号通路数据库查询筛选基因相关转导信号通路信息,并分析在腭裂发生发展过程中信号转导以及基因表达调控网络等相关信息.结果:基于腭裂与舌组织基因表达谱芯片结果,以两倍差异倍数为标准筛选差异表达基因,共发现差异基因2146个,其中发现上调的基因有1457个,下调的基因689个.未被注释的631个,已经注释1515个.上调的差异基因功能大多与粘多糖生物合成过程、小脑发育、间充质细胞正调控以及肌动蛋白聚合或解聚有关.下调的基因功能大多与神经管的闭合、Wnt受体的正负调控、细胞增殖的调控和细胞外基质组成有关.主要的差异基因相应信号转导通路如Metabolic pathway,Hedgehog signaling pathway,Wnt signaling pathway,MAPK signaling pathway等可能在腭裂的发生发展中起重要作用.结论:利用基因芯片技术,在维甲酸诱导腭裂小鼠舌组织中发现了涉及到多个信号通路的上千个差异基因表达,提示舌发育异常可能直接导致腭裂发生.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘波		50	105	4.0	9.0
2	丛蔚		17	99	6.0	9.0
3	肖晶		22	102	7.0	9.0
4	王媛媛		5	6	2.0	2.0
8	蒋玉玲		2	2	1.0	1.0