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地塞米松降解新基因的探讨
地塞米松降解新基因的探讨
作者:
张进
斯丹
李津阳
杨致邦
熊玉霞
蒋仁举
马廉举
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
伯克霍尔德菌
地塞米松
降解
基因
实时荧光定量PCR
摘要:
目的:探讨地塞米松降解代谢新基因,为构建高效、稳定的地塞米松降解基因工程菌提供思路.方法:根据新发现的地塞米松降解菌Burkholderia sp.CQ001 (B.CQ001)全基因纽测序和生物信息学分析,筛选疑似与地塞米松代谢相关的基因.提取B.CQ001总RNA逆转录为cDNA,以cDNA为模板,利用PCR技术快速克隆经实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)验证筛选出的新基因,测序鉴定后连接原核表达载体pET-28a-c(+),构建重组质粒pET-28a-Ivd.将pET-28a-Ivd转化感受态B.CQ001,高效液相色谱(HPLC)验证表达菌降解能力的提升.结果:从B.CQ001基因组中筛选出3个未知基因,分别为ORF05499、ORF05827、ORF06535,其表达产物分别为过氧化物还原酶、甾酮异构酶、异戊酰辅酶A脱氢酶;RT-qPCR分析显示,3个目的基因在地塞米松诱导后均有不同程度表达上调,基因ORF06535表达上调明显;在B.CQ001中过表达基因ORF06535,HPLC检测显示,表达菌对地塞米松磷酸钠和地塞米松的降解率可达到89.0%和80.0%,相比原菌B.CQ001有明显提升.结论:在B.CQ001中发现新的地塞米松降解相关基因ORF06535,并完成基因克隆和功能验证,为制备地塞米松及甾体激素污染的生物修复剂提供了新的基因信息.
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文献信息
篇名
地塞米松降解新基因的探讨
来源期刊
中国生物工程杂志
学科
生物学
关键词
伯克霍尔德菌
地塞米松
降解
基因
实时荧光定量PCR
年,卷(期)
2018,(1)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
15-24
页数
10页
分类号
Q78
字数
语种
中文
DOI
10.13523/j.cb.20180102
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
杨致邦
重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室
119
522
12.0
17.0
2
马廉举
重庆医科大学药学实验教学中心
15
97
5.0
9.0
3
蒋仁举
重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室
11
44
5.0
6.0
4
熊玉霞
重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室
5
6
1.0
2.0
5
张进
重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室
12
28
4.0
4.0
6
斯丹
重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室
3
5
1.0
2.0
7
李津阳
重庆医科大学临床医学专业一系
1
0
0.0
0.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(83)
共引文献
(40)
参考文献
(22)
节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
1983(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1992(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1994(1)
参考文献(0)
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1996(1)
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2000(1)
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参考文献(0)
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二级参考文献(1)
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2018(0)
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二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
伯克霍尔德菌
地塞米松
降解
基因
实时荧光定量PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国生物工程杂志
主办单位:
中国科学院文献情报中心
中国生物技术发展中心
中国生物工程学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1671-8135
CN:
11-4816/Q
开本:
大16开
出版地:
北京中关村北四环西路33号
邮发代号:
82-13
创刊时间:
1976
语种:
chi
出版文献量(篇)
4896
总下载数(次)
30
总被引数(次)
45351
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中国生物工程杂志2018年第3期
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中国生物工程杂志2018年第12期
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中国生物工程杂志2018年第10期
中国生物工程杂志2018年第1期
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