基于凝集素基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定

• 作者: YANG Rongchang 刘珍珍 宁长申 张璐 张龙现 胡苏辉 菅复春 陈凯丽
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 隐孢子虫 Lectin基因 SSU rRNA基因 基因分型
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 290-295
• 页数: 6页
• 分类号: R382
• 字数: 3745字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2018.00.045

摘要

目的 为了解隐孢子虫凝集素基因在不同分离株的序列差异及其遗传进化关系,以SSU rRNA基因作参照,评价Lectin基因位点作为隐孢子虫基因分型和进化关系分析的可行性.方法 采用巢式PCR,分别在Lectin和SSU rRNA位点处对本实验室分离保存的多个隐孢子虫分离株进行PCR的扩增.用Clustalx对扩增序列与参考序列进行比对,用MEGA5中的邻近法(Neighbor joining method NJ),进行进化树的构建.结果 基于Lectin基因位点,在C.parvum、C.hominis、C.cuniculus及其在SSU rRNA处与人源C.hominis极为相近的horse genotype、驴源C.hominis均成功扩增出了大小在450 bp左右的目的条带,并进行了进化树的分析,不同种类和同种不同动物来源的隐孢子虫分布在不同的分支上.结论 Lectin基因位点可很好的区分SSU rRNA序列极为相似的几种隐孢子虫,有望为人兽共患隐孢子虫分类和遗传研究提供新的基因靶标.