基于甾体皂苷的襄麦冬块根抑制性差减杂交文库的构建

• 作者: 余海忠 孙永林 王海燕 赵慧君
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 襄麦冬 SMART法 甾体皂苷 抑制性差减杂交 EST序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 245-252
• 页数: 8页
• 分类号: S567
• 字数: 4937字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2018.2.005

摘要

[目的]甾体皂苷是襄麦冬块根主要活性成分之一,为了能在分子水平上实现对相关基因的表达调控,从而使甾体皂苷含量的提高成为可能,筛选参与甾体皂苷合成的蛋白或酶就非常必要.[方法]本实验以襄麦冬始见期块根和采收期块根作为实验样品,构建了不同生育期襄麦冬块根抑制性差减杂交(SSH)文库.[结果]构建的始见期和采收期块根差减文库的外源片段,有效基因序列308条,长度主要分布在250～1000 bp左右,片段平均长度586.99 bp;文库样本序列注释上NR、SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM库的基因分别有65.26％、34.42％、63.96％、26.30％、14.94％;样本中分别有23和103个Unigene可注释上12个COG分类与19个KOG分类中;样本中有81个预测基因,可以注释到48种酶与映射到92个代谢通路上;样本基因功能在Biological Process分类中聚集于cellular process和metabiolie process,在Cellular Component主要聚集于cell、cell part和intracellular,在Molecular Function分类中主要聚集于catalytic activity,binding和transferase activity.[结论]本实验成功构建了基于甾体皂苷的襄麦冬块根抑制性差减杂交文库,筛选出一批差异表达目的基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王海燕	湖北文理学院化学工程与食品科学学院	79	72	5.0	6.0
2	余海忠	湖北文理学院化学工程与食品科学学院	46	100	5.0	7.0
3	孙永林	湖北文理学院化学工程与食品科学学院	27	43	3.0	5.0
4	赵慧君	湖北文理学院化学工程与食品科学学院	40	72	6.0	6.0