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摘要:
[目的]分析杭白芷种质资源的遗传多样性,为其可持续利用及品种选育研究提供理论依据.[方法]从已发表的18对白芷同属植物当归(Angelica sinensis)SSR引物中,筛选出6对具有较高多态性的引物,对3个杭白芷种群[KZ (昆明)、NZ(南京)和XY(咸阳)]的53份种质材料进行PCR扩增,根据其基因型数据,分别采用Genepop 4.0、GenALEx 6.4.1和Structure 2.2进行遗传多样性、遗传差异及聚类分析.[结果]6个SSR位点共扩增出37.0个等位基因,平均每个位点的等位基因数(Na)6.2个、有效等位基因数(Ne)1.798个,Shanon信息指数(I)1.802,观测杂合度(Ho)0.245,期望杂合度(He)0.304,基因流(Nm)为1.340.3个种群的遗传多样性存在一定差异,其中KZ种群遗传多样性最高(Na 3.8个,Ho 0.481,He 0.508).3个杭白芷种群可聚类分成两组,KZ种群独成一组,NZ种群和XY种群聚为一组,表明XY种群与NZ种群亲缘关系较近.XY种群与NZ种群间的遗传分化指数(FST)较低(0.208),表明二者遗传分化程度较低,遗传差异较小;KZ种群与NZ种群和XY种群间的FST均较高(0.510和0.506),表明KZ种群与NZ种群和XY种群遗传分化程度较高,遗传差异较大.[结论]同属不同种的SSR引物具有一定通用性.不同来源地的杭白芷种群间存在一定程度的遗传分化,但总体遗传多样性较低,应加大力度寻找其近缘野生资源,保障白芷种质资源的可持续利用.
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文献信息
篇名 杭白芷种质资源遗传多样性的SSR分析
来源期刊 南方农业学报 学科
关键词 杭白芷 SSR 遗传多样性 遗传分化 聚类分析
年,卷(期) 2018,(3) 所属期刊栏目 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
研究方向 页码范围 418-423
页数 6页 分类号 S567.024
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.03.02
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 田恩伟 南方医科大学中医药学院 5 25 2.0 5.0
2 叶浩婷 南方医科大学中医药学院 4 4 2.0 2.0
3 刘倩倩 1 2 1.0 1.0
4 李放 南方医科大学中医药学院 1 2 1.0 1.0
5 王荣婷 南方医科大学中医药学院 1 2 1.0 1.0
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遗传多样性
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研究起点
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期刊影响力
南方农业学报
月刊
2095-1191
45-1381/S
大16开
1964-01-01
chi
出版文献量(篇)
7029
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