中国新型布尼亚病毒分离株序列基因特征分析

• 作者: 刘秀兰 姚学君 姜仁杰 管书慧
• 来源期刊: 江苏预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 新型布尼亚病毒 基因特征 序列分析 流行病学特征
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 病原检测专题论著
• 页码范围: 119-121
• 页数: 3页
• 分类号: R373.3
• 字数: 2367字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13668/j.issn.1006-9070.2018.02.001

摘要

目的 分析中国新型布尼亚病毒分离株的基因型分布和进化规律,了解分子流行病学特征.方法 利用MEGA 6.0软件,对GenBank数据库收录的中国地区分离株的完整S片段基因序列进行分析,构建系统进化树,并分析毒株间的核苷酸和氨基酸的同源性.结果 在GenBank数据库收集到248株中国地区新型布尼亚病毒分离株,主要为人源毒株232株,占93.55%,核酸和氨基酸序列同源性分别为94.9%～96.8%和91.4%～95.2%;系统进化树分析显示中国地区流行优势株为C2基因亚型,占58.06%;5种亚型的核苷酸序列和氨基酸序列同源性为94.9%～96.8%、91.4%～95.2%,同亚型毒株核苷酸序列和氨基酸序列同源性为96.3%～99.1%、96.8%～98.6%.与汉坦病毒属和白蛉病毒属亲缘较远,毒株核苷酸序列同源性分别为39.3%～40.2%和47.3%～48.1%,氨基酸序列同源性13.6%～14.4%和22.5%～23.9%.人源毒株与宿主动物分离株高度同源,核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为96.3%～97.1%和94.0%～95.7%.结论 我国近年来新型布尼亚病毒流行毒株以基因亚型C2为主,存在多种基因亚型间循环交替流行.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘秀兰		17	34	4.0	5.0
2	姜仁杰		33	128	6.0	10.0
3	姚学君		19	28	3.0	4.0
4	管书慧		15	40	4.0	6.0