“云新高原”核桃及其亲本的叶绿体DNA差异分析

• 作者: 吴涛 宁德鲁 肖良俊 陈少瑜 陈海云
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 核桃 深纹核桃 云新高原核桃 种间杂交 叶绿体DNA
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 2024-2029
• 页数: 6页
• 分类号: S664
• 字数: 4266字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2018.10.006

摘要

[目的]研究核桃人工种间杂交种云新高原与其亲本(母本为漾濞泡核桃,父本为云林A7)的叶绿体DNA的差异,了解核桃叶绿体DNA的遗传规律,并挖掘多态性高的叶绿体基因片段.[方法]基于NCBI数据库中深纹核桃和核桃叶绿体全基因组序列的比对和分析,针对其中的变异位点设计引物,进而对云新高原及其母本漾濞泡核桃、父本早实核桃云林A7的目的基因片段进行多态性检测.[结果]深纹核桃与核桃的叶绿体基因组存在14个变异位点、30个碱基的差异,其中7个为核苷酸多态性变异(SNP),7个为碱基插入/缺失变异(InDel).对云新高原及其亲本的这14个位点及其附近片段进行检测,发现三者有33个变异位点,云新高原与其母本在其中21个位点上保持相同碱基,占全部变异位点数的64％;云新高原与其父本在余下12个位点上保持相同碱基,占全部变异位点数的36％.这33个变异位点分属11个基因或基因间隔区片段,可以分为11个单倍型,云新高原的这11个单倍型中有10个与母本相同,1个为双亲的嵌合体.[结论]核桃叶绿体DNA的遗传方式为以母系遗传为主的双亲遗传;核桃ndhF-rpl32DNA片段存在多个变异位点,是多态性高的叶绿体基因片段,可广泛应用于核桃系统发育、群体遗传和种内品种鉴定等研究.