储存血小板差异性长链非编码RNA表达谱研究

• 作者: 张怡宇 李楠 苑召虎 陈小洁 魏亚明 黄建云
• 来源期刊: 中国输血杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 血小板 长链非编码RNA RNA表达谱 血小板储存损伤 基因芯片 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 基础医学与实验研究
• 页码范围: 27-32
• 页数: 6页
• 分类号: R331.1+43|R457.1+2|Q522
• 语种: 中文
• DOI: 10.13303/j.cjbt.issn.1004-549x.2018.01.008

摘要

目的 探讨机采血小板储存过程中差异性lncRNA表达谱变化及其差异表达的lncRNA在血小板储存损伤中潜在的生物学功能.方法 收集13(人)份O型健康男性机采血小板各50 mL,于(22±2)℃下震荡储存,应用lncRNA芯片技术检测储存2、5、8d机采血小板中lncRNA和mRNA表达谱变化;运用GO分析及KEGG分析预测差异表达的lncRNA功能分布,通过顺式调控分析预测lncRNA调控邻近蛋白编码基因表达的分子机制;采用实时PCR(RT-PCR)技术,验证8条lncRNA(MARCH2-2∶1、SLC2A2-1∶1、WBSCR16-3∶6、WEE 1-2∶1、ENTPD6-2∶1、NKD2-1∶1、FOXS1-2∶1、MAPK13-3∶1)和4条mRNA(BCL2L1、CAPN2、MAPK14、VAMP8)的表达.结果 芯片检测:血小板储存5与2d相比,有162种lncRNA的表达量发生明显变化,表达升高的4种、降低的158种;8与2d相比,有691种lncRNA表达量发生明显变化,表达升高的20种、降低的671种;8与5d相比,246种lncRNA表达量发生明显变化,升高的2种,降低的244种.GO和KEGG分析:差异表达的lncRNA可能参与的生理过程有血小板激活、血小板聚集、内吞、凋亡、肌动蛋白纤维聚集、肌动蛋白骨架的调节;顺式调控分析:lncRNA具有调控血小板相关mRNA表达的功能,USP39-1调控VAMP8的表达、TMEM86B-2调控GP6的表达、FOXS1-2调控BCL2L1的表达等.RT-PCR验证:与芯片检测结果一致,其中lncRNA MARCH2-2∶1、WEE 1-2∶1和NKD2-1∶1表达量升高,WBSCR16-3∶6、SLC2A2-1∶1、ENTPD6-2∶1、FOXS 1-2∶1和MAPK13-3∶1表达量下降,BCL2L1,CAPN2,MAPK14和VAMP8的表达量也下降.结论 血小板中含有大量的lncRNA,其表达量随着血小板储存时间延长而呈不同的变化趋势,总体来讲下调的lncRNA数量较多,且下调的幅度较大.部分变化的lncRNA可能与血小板生理功能密切相关,并且在血小板储存损伤中发挥作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苑召虎	广州医科大学附属广州市第一人民医院输血科	6	7	2.0	2.0
2	魏亚明	广州医科大学附属广州市第一人民医院输血科	10	37	4.0	6.0
3	李楠	广州医科大学附属广州市第一人民医院输血科	12	4	1.0	1.0
4	陈小洁	广州医科大学附属广州市第一人民医院输血科	2	0	0.0	0.0
5	黄建云	广州医科大学附属广州市第一人民医院输血科	2	1	1.0	1.0
6	张怡宇	广州医科大学附属广州市第一人民医院输血科	2	1	1.0	1.0