中波紫外线诱导的提前衰老成纤维细胞中环状RNA的表达及分析

• 作者: 司晨琛 周炳荣 骆丹
• 来源期刊: 中国美容医学
• 学科: 医学
• 关键词: 提前衰老成纤维细胞 环状RNA 基因芯片 竞争结合 生信分析 中波紫外线
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 128-130,162
• 页数: 4页
• 分类号: R329.2
• 字数: 3571字
• 语种: 中文

摘要

目的:对于中波紫外线诱导的提前衰老的人类真皮成纤维细胞(UVB stress induced premature senescence,UVB-SIPS),笔者使用基因芯片筛选了其中环状RNA的表达谱.方法:构建UVB-SIPS模型;采用β-gal染色、细胞周期、CCK8(cell counting kit)检测衰老成纤维细胞;基因芯片技术筛选差异表达的环状RNA;聚合酶链式反应验证相关环状RNA;利用Clusterprofiler r package,对上下调基因分别进行KEGG和GO的富集分析.结果:与对照组比较(差异表达倍数≥1.5,P<0.05),共有472个差异表达的环状RNA,其中228个环状RNA上调,244个环状RNA下调.在472个差异表达的环状RNA中随机选择了8个环状RNA进行聚合酶链式反应.其中有5个环状RNA(hsa_circRNA_100797,hsa_circRNA_100686,hsa_circRNA_400036,hsa_circRNA_101755,hsa_circRNA_003794)与基因芯片的结果一致.GO分析显示,UVB-SIPS组细胞中差异表达的环状RNA亲本基因与细胞对紫外线辐射的反应、DNA修复复合物、有丝分裂、微管蛋白结合等注释条目有关;KEGG分析显示,UVB-SIPS组细胞与未处理组细胞相比,差异表达的环状RNA的亲本基因可能参与与衰老相关的细胞周期、p53信号通路、PPAR信号通路等的调节.结论:本研究初步揭示了提前衰老的人类真皮成纤维细胞中环状RNA的表达,可为未来研究光老化发生机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	骆丹	南京医科大学第一附属医院皮肤科	285	1313	16.0	23.0
2	周炳荣	南京医科大学第一附属医院皮肤科	91	348	8.0	13.0
3	司晨琛	南京医科大学第一附属医院皮肤科	4	1	1.0	1.0