上海郊区10株人乳头状瘤病毒6型的L1基因序列和进化树分析

• 作者: 夏淑华 孙忠辉 张丹露 祝英 郭韫懿 陈静华
• 来源期刊: 皮肤病与性病
• 学科: 医学
• 关键词: 人乳头状瘤病毒 基因型 序列 进化树
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 173-176
• 页数: 4页
• 分类号: R752|R752.02
• 字数: 3136字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-1310.2018.02.008

摘要

目的 了解上海郊区人乳头状瘤病毒(HPV)6型L1基因在不同疣组织(尖锐湿疣和寻常疣)结构特点和变异规律,为临床治疗和预防提供理论依据.方法 采用PGMY09/11通用引物扩增的方法进行HPV基因分型,8例尖锐湿疣和2例寻常疣HPV 6型阳性标本再进行L1基因直接测序;测序结果进行BLAST;然后;进一步用Geneious软件对测序结果与GenBank中发布的其他国家及国内的HPV6型病毒株L1基因序列比对,同时进行进化树构建.结果 与参考株X00203相较共出现11种同义突变和3种错义突变.从BLAST结果和构建的系统进化树图可以看出,本地区HPV6型病毒株中,样本13639、14960、15987和15989是HPV6的A型;14300、16320、14304、15976、15982和15330是HPV6的B1型.结论 本地区皮肤疣感染的HPV6型4株为A系,6株为B1亚系,与国内外HPV6型病毒株基因都有同源性背景.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	夏淑华	上海市奉贤区奉城医院妇产科	12	55	3.0	7.0
2	孙忠辉	奉贤区皮肤病防治所皮肤科	2	1	1.0	1.0
3	张丹露	奉贤区皮肤病防治所皮肤科	1	1	1.0	1.0
4	祝英	奉贤区皮肤病防治所皮肤科	1	1	1.0	1.0
5	郭韫懿	奉贤区皮肤病防治所皮肤科	1	1	1.0	1.0
6	陈静华	上海市奉贤区奉城医院妇产科	5	26	2.0	5.0