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人乳头瘤病毒6型基因组晚期区序列分析
人乳头瘤病毒6型基因组晚期区序列分析
作者:
宋国兴
张明策
王淼
许雪梅
陈连凤
原文服务方:
中国医学科学院学报
尖锐湿疣
人乳头瘤病毒6型
晚期区
摘要:
目的初步分析我国尖锐湿疣患者病变组织分离的乳头瘤病毒6型(HPV-6)基因组晚期区编码序列变异情况.方法采用重叠PCR设计,分别从HpV-6阳性尖锐湿疣患者病变组织扩增出主要衣壳蛋白L1和次要衣壳蛋白L2基因片段,插入质粒载体克隆,经测序、拼接获得HPV-6基因组晚期区序列.结果得到的两条长2 869 bp的HPV-6晚期区序列(GenBank序列索取号AY015006,AY015008)均具有完整的L1和L2开放阅读框(ORF),与原型序列比较,在L1和L2 ORF中共有9个核苷酸变异,其中错义突变4个(有3个发生在L2 ORF,1个在L1ORF).分子进化分析表明,克隆的晚期区序列属于HPV-6b亚型.结论 HPV-6基因组晚期区编码序列非常保守(核苷酸变异率小于0.28%),并且L1 ORF比L2 ORF更为保守,其中位于L1 ORF中7 081位的A→G和7 099位的G→A两处共有突变在我国HPV-6分离物中具有代表性.本研究首次从我国尖锐湿疣组织标本克隆了HPV-6基因组晚期区全长编码序列.
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文献信息
篇名
人乳头瘤病毒6型基因组晚期区序列分析
来源期刊
中国医学科学院学报
学科
关键词
尖锐湿疣
人乳头瘤病毒6型
晚期区
年,卷(期)
2001,(6)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
568-572
页数
5页
分类号
R373.9
字数
语种
中文
DOI
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期刊影响力
中国医学科学院学报
主办单位:
中国医学科学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-503X
CN:
11-2237/R
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1979-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
3666
总下载数(次)
0
总被引数(次)
43527
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国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
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学科类型:
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