miR-1254在结肠癌中调控差异表达基因及信号通路研究

• 作者: 周锋利 孙伟杰 彭海霞 徐莹 杨大明 董小燕 褚以忞 陈曦 韩雨彤
• 来源期刊: 临床军医杂志
• 学科: 医学
• 关键词: miR-1254 结肠癌 高通量RNA测序分析
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1398-1401
• 页数: 4页
• 分类号: R735.3
• 字数: 3127字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16680/j.1671-3826.2018.12.02

摘要

目的 探讨miR-1254对结肠癌发生发展的影响及其在结肠癌中调控的差异表达基因(DEG)和信号通路.方法 在人结肠癌细胞系SW1116中瞬转miR-1254模拟体,通过高通量RNA测序分析(RNA-seq),筛选出受miR-1254调控的DEG,由生物信息学分析这些DEG所涉及的信号通路和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络.结果 通过RNA-seq,筛选出了217条DEG.其中,121条下调基因,96条上调基因.这些基因主要富集在p53信号通路、氨酰-tRNA生物合成和内吞、甘氨酸/丝氨酸/苏氨酸代谢以及N-聚糖生物合成等信号通路中.PPI网络显示,结合蛋白较多的5个中心节点蛋白为UMPS、EGR1、CDKN1A、YARS以及ASNS.结论 miR-1254是一个多功能miRNA,在结肠癌发生发展中起重要作用.