利用GEO结肠癌芯片数据分析FOXC1及其相关基因的表达与意义

• 作者: 刘曙光 许伟珊 马红梅
• 来源期刊: 国际医药卫生导报
• 关键词: 结肠肿瘤 基因表达 FOXC1 基因芯片
• 年，卷（期）: 2018,（23）
• 所属期刊栏目: 科研课题
• 页码范围: 3535-3538
• 页数: 4页
• 字数: 2710字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-1245.2018.23.003

摘要

目的 探讨叉头框C1(forkhead box C1,FOXC1)在结肠癌的表达水平与临床病理特征及预后的关系,并分析预测与其表达密切相关的基因及其参与的生物过程.方法 利用高通量基因表达(Gene expression omnibus,GEO)数据库中结肠癌基因芯片数据分析FOXC1与临床病理特征及预后的相关性,采用R2平台,筛选出与FOXC1表达显著相关的基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书通路分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析.结果 FOXC1的表达与肿瘤分化程度有关(χ2=7.919,P=0.019).Kaplan-Meier法分析显示FOXC1的表达与患者的总生存期有相关性(P=0.045).采用R2平台检测出与FOXC1表达显著相关基因共608个(其中正相关387个、负相关221个),对GO及KEGG通路分析后发现FOXC1高表达的肿瘤样本富集到其中564相关基因,主要涉及到血管生成、细胞增生、凋亡、细胞粘附、蛋白磷酸化信号传导、转录因子结合和上皮间质转化等多个肿瘤发生、发展过程.肿瘤信号通路主要涉及Wnt信号通路.结论 FOXC1表达在结肠癌中是一种不良预后因素,可作为判断预后的标志物.FOXC1表达相关的基因参与了多个结肠癌生物过程和信号通路,可为结肠癌分子标志物的深入研究提供参考.