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MiR-30靶向BECLIN1在胃癌中的作用及其机制研究
MiR-30靶向BECLIN1在胃癌中的作用及其机制研究
作者:
张毅强
曹文君
裴振
霍小蕾
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
胃癌
miRNA-30
beclin1
作用机制
摘要:
目的 基于二代测序技术分析胃癌组织中miRNA-30的表达差异,采用生物信息学方法 分析其靶基因及相关功能注释和信号通路富集,以期揭示miRNA-30在胃癌中的诊断价值及临床意义.方法收集2015年9月—2016年12月本院住院胃癌患者60例和同期对照健康人群50例标本,用高通量测序技术检测其中3例胃癌及癌旁组织中差异表达的miRNA,利用R 3.4.0软件绘制热图,并用荧光定量PCR(qPCR)验证miRNA-30和beclin1的差异表达.应用miRBase数据库预测miRNA-30的靶基因.利用cytoscape 3.5.1及其插件ClueGO进行GO(gene ontology)富集,利用DAVID数据库进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路注释.利用miRNet数据库绘制miRNA-30与mRNA表达调控网络.结果 二代测序结果显示,胃癌组织中miRNA-30表现为下调.qRT-PCR验证支持这一结果(P<0.001).GO功能注释主要富集于MAPKK活性、干细胞发育、STAT蛋白酪氨酸磷酸化的调控、蛋白质磷酸化氨基酸结合、酪氨酸磷酸化肽、调节脂质激酶活性、磷蛋白聚合、核转录mRNA聚A尾缩短等生物学过程和分子功能(P<0.01);KEGG信号通路富集主要涉及TP53基因调节细胞死亡基因的转录、TOR信号通路、Wnt信号通路、Hippo信号通路中(P<0.01).调控网络表明miRNA-30参与包括beclin1在内的多种靶基因的直接调控.结论 miRNA-30在胃癌组织中表达水平下调,作为胃癌的抑癌因子,miRNA-30的靶基因、功能注释和信号通路注释富集于与消化肿瘤相关的生物信息中.
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上皮间质转化
内容分析
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内容分析
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关键词热度
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文献信息
篇名
MiR-30靶向BECLIN1在胃癌中的作用及其机制研究
来源期刊
齐齐哈尔医学院学报
学科
医学
关键词
胃癌
miRNA-30
beclin1
作用机制
年,卷(期)
2018,(4)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
380-383
页数
4页
分类号
R573
字数
3360字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1002-1256.2018.04.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
霍小蕾
27
71
6.0
6.0
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裴振
10
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3.0
4.0
3
曹文君
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张毅强
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研究主题发展历程
节点文献
胃癌
miRNA-30
beclin1
作用机制
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
齐齐哈尔医学院学报
主办单位:
齐齐哈尔医学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
1002-1256
CN:
23-1278/R
开本:
大16开
出版地:
黑龙江省齐齐哈尔市建华区卜奎北大街333号
邮发代号:
14-257
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
39496
总下载数(次)
38
总被引数(次)
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