葡萄中4个花发育相关MADS-box基因的表达与生物信息分析

• 作者: 刘榕晨 李雪雪 焦晓博 纪薇 罗尧幸 赵伟 韩凯 高美英
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 葡萄 花发育 MADS-box基因 转录组 生物信息分析
• 年，卷（期）: 2018,（20）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 6572-6582
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.016.006572

摘要

MADS-box转录因子是调节植物开花的一类重要的转录调控因子.为了研究葡萄花发育相关MADS-box基因在花器官生长发育过程中的表达特征,本试验以‘北醇’葡萄两性花生长发育过程中三个时期的花器官为试材,对其进行转录组测序分析后筛选出4个注释为花发育相关功能且表达水平较高的MADS-box基因家族成员,进行生物信息分析.结果表明,4个MADS-box基因均含有内含子和外显子结构,各基因CDS区域均较为分散,呈现断裂基因特征;对各基因进行启动子顺式作用元件分析,均包含多类花发育相关的功能元件;基于转录组结果数据,4个葡萄MA DS-box基因在花器官发育的三个时期均有表达,VIT_14s0083g01050与VIT10s0003#2070的表达量呈逐渐下降的趋势,而VIT_1 8s 0001g01760与VIT_15s-0048g01270的表达量先上升后下降,且VIT_18s0001g01760在S1时期的表达水平显著高于其它基因;分析4个基因基本信息及其蛋白理化性质发现,各基因结构极为相似;多物种系统进化树表明,VIT_18s0001g017-60与黄瓜中己知花发育相关基因CUM26同源性最高,初步推测其可能与葡萄花发育过程具有较高相关性.本研究为MA DS-box基因功能研究提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵伟		8	8	2.0	2.0
2	纪薇		40	85	5.0	7.0
3	高美英		31	216	8.0	14.0
4	韩凯		7	6	2.0	2.0
5	焦晓博		5	4	1.0	1.0
6	罗尧幸		7	12	2.0	2.0
7	刘榕晨		5	10	2.0	2.0
8	李雪雪		4	5	2.0	2.0