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基于互信息算法的抗前列腺癌药物重定位分析
基于互信息算法的抗前列腺癌药物重定位分析
作者:
杨光
郝逸凡
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
药物重定位
前列腺癌
互信息
connectivity map
摘要:
药物重定位研究不仅大大减少了新药开发的周期,还降低了经济成本,越来越受到医药界的重视.前列腺癌是世界上死亡率较高的癌症,近年来针对单个基因的研究不足以分析癌症的复杂发病机理.首先,应用R软件的互信息方法分析前列腺癌的基因表达数据并提取前列腺癌特征基因,得到从失联到关联状态下含有大量致病基因信息的特征基因.然后,通过cmap分析确定了几种治疗前列腺癌的药物.使用的基因表达数据来自TCGA,通过互信息分析算法发现了294条上调基因和362条下调基因.对这些特征基因进行cmap分析,发现了多种化合物对前列腺癌具有抑制作用,通过cmap负相关分数降序排列,得到了Thioridazine(硫利达嗪)、trichostatin A(曲古菌素A)等更可能对前列腺癌有抑制作用的药物.
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诊断
基于机器学习算法的前列腺癌诊断模型研究
前列腺癌
前列腺增生
诊断模型
Logistic回归
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文献信息
篇名
基于互信息算法的抗前列腺癌药物重定位分析
来源期刊
沈阳师范大学学报(自然科学版)
学科
工学
关键词
药物重定位
前列腺癌
互信息
connectivity map
年,卷(期)
2019,(1)
所属期刊栏目
统计学
研究方向
页码范围
34-37
页数
4页
分类号
O212|TP311
字数
3441字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1673-5862.2019.01.007
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
杨光
沈阳师范大学数学与系统科学学院
84
321
10.0
14.0
2
郝逸凡
沈阳师范大学数学与系统科学学院
3
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药物重定位
前列腺癌
互信息
connectivity map
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
沈阳师范大学学报(自然科学版)
主办单位:
沈阳师范大学
出版周期:
季刊
ISSN:
1673-5862
CN:
21-1534/N
开本:
大16开
出版地:
沈阳市皇姑区黄河北大街253号
邮发代号:
8-103
创刊时间:
1983
语种:
chi
出版文献量(篇)
2465
总下载数(次)
4
总被引数(次)
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