人支气管上皮HBE细胞中p53相关的放射诱导表达长链非编码RNA的鉴定和生物功能预测分析

• 作者: 周平坤 胡赛 黄波 黄瑞雪
• 来源期刊: 中国药理学与毒理学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: γ射线 长链非编码RNA p53 支气管上皮细胞
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 587-594
• 页数: 8页
• 分类号: Q691|R394-33
• 字数: 4561字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3867/j.issn.1000-3002.2019.08.005

摘要

目的 鉴定人支气管上皮HBE细胞中p53相关的γ射线诱导表达的长链非编码RNA(IncRNA)分子,为研究与p53关联的IncRNA分子在放射损伤反应如上皮间充质转化中的作用机制提供信息.方法 使用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建p53敲除的人支气管上皮细胞(HBEp53-/-),Western印迹法检测P53表达水平,IncRNA芯片杂交分析IncRNA表达谱的改变,实时定量RT-PCR分析验证部分IncRNA分子的表达变化,生物信息学技术分析差异变化IncRNA的生物学功能.结果 与野生型HBE细胞相比,HBEp53-/-细胞在照射后有239条IncRNA出现上调表达,287条出现下调表达.上调和下调表达前5位IncRNA的差异表达变化经PCR得到验证.生物信息学GO分析表明,前10位差异表达的IncRNA的靶基因主要涉及β3肾上腺素受体结合蛋白、酪氨酸激酶活性蛋白、DNA结合蛋白、锌离子跨膜转运体蛋白、突触融合蛋白结合蛋白和泛素结合蛋白等分子功能.KEGG分析表明,差异表达IncRNA的靶基因功能的生物体系统主要涉及感知、神经、免疫、内分泌、环境适应、发育和循环系统等.结论 鉴定了人支气管上皮HBE细胞中与p53相关的放射诱导IncRNA分子;经生物信息学预测,发现这些IncRNA分子在细胞照射应答过程中,涉及多种生理功能,参与多个功能信号通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄波	南华大学公共卫生学院	72	232	8.0	11.0
2	黄瑞雪	中南大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学系	15	67	5.0	8.0
3	胡赛	南华大学公共卫生学院	5	3	1.0	1.0
4	周平坤	军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京市放射生物学重点实验室	5	0	0.0	0.0