基于SSR标记的杨树新品种鉴定及核心引物筛选

• 作者: 张会恰 杜向前 杨敏生 王世杰 王雪婷 陈洪刚
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杨树新品种 SSR标记 核心引物
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 101-110
• 页数: 10页
• 分类号: S722.3|S792.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.13332/j.1000-1522.20190110

摘要

[目的]利用经过长期筛选的11对SSR引物对50份杨树新品种(系)进行扩增,探究11对引物的品种鉴定能力和核心引物的筛选依据,为杨树新品种的鉴定、育种工作和核心引物的筛选工作奠定基础.[方法]使用毛细管电泳技术对扩增结果进行检测,计算等位重复序列数、Shannon信息指数和引物多态性信息指数等.按0/1矩阵记录扩增条带的有无,并通过非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析.计算单个引物和11对引物组合的遗传相似系数,分析遗传相似系数之间的相关性,剔除相关性较低的引物,再对剩余的引物组合进行聚类分析.[结果]11对引物共扩增出122个DNA片段,平均每对引物扩增的等位重复序列数为11.091个:不同引物PIC值的变化范围是0.530 ～ 0.908,平均值为0.803.11对引物的聚类结果显示,当支距为0.40时,参试样品可以分为2个大类;当支距为0.37时,可分为4个亚类,聚类结果与品种(系)的谱系来源基本吻合.在11对现有引物的基础上,通过分析单个引物和11对引物的遗传相似系数之间的相关性,优化得到9对核心引物.相关性分析和聚类分析表明,优化后的9对引物具有高效鉴定能力和亲缘关系聚类效果.[结论]本研究证实SSR分子标记可以有效鉴定杨树新品种,并较好反映品种之间的亲缘关系;同时,利用遗传相似系数的相关性可优化现有的引物,为杨树的育种及核心引物的筛选工作提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨敏生	河北农业大学林学院	149	2847	30.0	47.0
2	张会恰		8	6	1.0	2.0
3	杜向前		5	6	2.0	2.0
4	王世杰	河北农业大学林学院	2	2	1.0	1.0
5	王雪婷	河北农业大学林学院	1	0	0.0	0.0
6	陈洪刚		1	0	0.0	0.0