桂花EST-SSR引物开发及在品种鉴定中的应用

• 作者: 付建新 张超 李军 胡绍庆 董彬 赵宏波
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 植物学 桂花 EST-SSR 体系优化 引物筛选 品种鉴定
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 306-313
• 页数: 8页
• 分类号: S685.13|Q75
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.02.015

摘要

利用L16(45)正交实验设计,针对模板DNA,镁离子(Mg2+), dNTPs, TaqDNA酶和引物5个因素进行正交优化,建立适用于桂花Osmanthus fragrans表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)的最优扩增反应体系,将其用于桂花转录组EST-SSR多态性引物的筛选,最后利用筛选得到的多态性引物和聚类分析对14份四川省常见的栽培丹桂(SC01~SC14)样本进行品种鉴定.结果表明:桂花EST-SSR最优反应体系包含40 ng模板DNA, 2.25 mmol·L-1Mg2+, 0.3 μmol·L-1引物,0.3 mmol·L-1dNTPs, 1.25×16.67 nkat TaqDNA聚合酶,10×PCR Buffer缓冲液2 μL,双蒸水补至20 μL;从150对EST-SSR引物中筛选得到了19对稳定性好、多态性高的SSR引物,多态性从高到低依次为五核苷酸(25.00%),六核苷酸(19.44%)和三核苷酸(16.67%)重复类型.利用筛选得到的3对高度多态性 SSR引物(OF8623-1677, OF24299-844和OF28774-2088)对四川省成都市周边常见栽培的14份丹桂(Aurantiacus group)样本进行了有效鉴定.结果表明:14份样本中,有12份可判定为 '朱砂丹桂''Zhusha Dangui', SC06为 '堰红桂''Yanhong Gui', SC08与 '满条红''Mantiao Hong'和 '状元红''Zhuangyuan Hong'亲缘关系较近.本研究也为今后利用EST-SSR标记对桂花指纹图谱构建、遗传多样性分析、分子育种及品种鉴定与保护等工作奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张超	浙江农林大学风景园林与建筑学院	44	270	8.0	14.0
2	胡绍庆	浙江理工大学建筑工程学院	41	142	7.0	10.0
3	董彬	浙江农林大学风景园林与建筑学院	13	23	3.0	3.0
4	赵宏波	浙江农林大学风景园林与建筑学院	30	133	7.0	10.0
5	付建新	浙江农林大学风景园林与建筑学院	18	63	4.0	6.0
6	李军	浙江农林大学风景园林与建筑学院	1	4	1.0	1.0