福氏志贺菌PFGE和MLVA分子分型方法的应用与评价

• 作者: 杨劲松 林杰 罗朝晨 郑恩惠 陈建辉 陈爱平
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 福氏志贺菌 PFGE MLVA 遗传进化
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 245-249,253
• 页数: 6页
• 分类号: R378.21
• 字数: 4523字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2019.00.228

摘要

目的 比较和评价脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)和多位点可变数目串联重复序列分析技术(MLVA)在福建地区福氏志贺菌研究中的应用.方法 运用PFGE和MLVA技术对43株分离自福建地区的福氏志贺菌进行分子分型,结合流行病学资料分析比较分型效果.结果 43株福氏志贺菌经PFGE分型后相似度在61.70％～100％之间,按照100％的相似水平可分为36个PFGE型,没有优势PFGE型别,分辨系数为0.992 2,存在4个优势簇(G1～G4);福氏志贺菌经MLVA分型后,按照100％的相似水平可分为41个MLVA型别,遗传关联度介于6.207％～100％之间,没有优势MLVA型别,分辨系数为0.997 8,得到5个优势基因群(Cluster1～5).在最小生成树上,部分F4c与Fx亲缘关系较近,并都由F2a和F1a分支而来,表现出一定的遗传关系.结论 两种分型方法的分辨率基本一致,PFGE分型结果与流行病学背景资料及血清型别基本吻合,MLVA在分析菌株种群进化关系上更具优势.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗朝晨		27	205	9.0	13.0
2	林杰		18	120	8.0	10.0
3	陈爱平		35	175	9.0	10.0
5	杨劲松		29	156	8.0	10.0
9	郑恩惠		4	4	2.0	2.0
12	陈建辉		21	89	5.0	8.0