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摘要:
目的 比较和评价脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)和多位点可变数目串联重复序列分析技术(MLVA)在福建地区福氏志贺菌研究中的应用.方法 运用PFGE和MLVA技术对43株分离自福建地区的福氏志贺菌进行分子分型,结合流行病学资料分析比较分型效果.结果 43株福氏志贺菌经PFGE分型后相似度在61.70%~100%之间,按照100%的相似水平可分为36个PFGE型,没有优势PFGE型别,分辨系数为0.992 2,存在4个优势簇(G1~G4);福氏志贺菌经MLVA分型后,按照100%的相似水平可分为41个MLVA型别,遗传关联度介于6.207%~100%之间,没有优势MLVA型别,分辨系数为0.997 8,得到5个优势基因群(Cluster1~5).在最小生成树上,部分F4c与Fx亲缘关系较近,并都由F2a和F1a分支而来,表现出一定的遗传关系.结论 两种分型方法的分辨率基本一致,PFGE分型结果与流行病学背景资料及血清型别基本吻合,MLVA在分析菌株种群进化关系上更具优势.
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关键词云
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文献信息
篇名 福氏志贺菌PFGE和MLVA分子分型方法的应用与评价
来源期刊 中国人兽共患病学报 学科 医学
关键词 福氏志贺菌 PFGE MLVA 遗传进化
年,卷(期) 2019,(3) 所属期刊栏目 实验研究
研究方向 页码范围 245-249,253
页数 6页 分类号 R378.21
字数 4523字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1002-2694.2019.00.228
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 罗朝晨 27 205 9.0 13.0
2 林杰 18 120 8.0 10.0
3 陈爱平 35 175 9.0 10.0
5 杨劲松 29 156 8.0 10.0
9 郑恩惠 4 4 2.0 2.0
12 陈建辉 21 89 5.0 8.0
传播情况
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福氏志贺菌
PFGE
MLVA
遗传进化
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中国人兽共患病学报
月刊
1002-2694
35-1284/R
大16开
福建省福州市津泰路76号
34-46
1985
chi
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