MLVA方法在军团菌分子分型中的应用评价

• 作者: 任红宇 关红 周海健 朱兵清 邵祝军
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 军团菌 嗜肺军团菌 分子分型 MLVA
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 256-260,283
• 分类号: R183.3
• 字数: 3373字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2012.03.015

摘要

目的 探讨MLVA方法在军团菌分型中的可应用性.方法 选用文献报道的9个军团菌VNTR位点,对我国环境水中分离的81株Lp1型军团菌菌株和2株参考菌株进行分子分型研究,并与PFGE和SBT分型结果进行了比较.结果 81株分离菌株9个VNTR位点的等位基因型别数分别为6,3,4,2,3,3,2,4和7,其中部分菌株的某些位点无扩增产物或产物为非目的 片断.7个位点PCR产物具有重复单元;Lpms3位点PCR产物无重复单元;Lpms31位点部分菌株PCR产物有重复单元,另一些菌株无重复单元.对于具有重复单元的序列,不同菌株间以及同一菌株内各重复单元的序列变异均较大,3个位点存在不完整的重复单元.根据8个位点的PCR产物电泳结果,81株Lp1型分离菌株分为19个MLVA型.通过PFGE和SBT方法,81株Lp1型分离菌株分别分为46种PFGE带型和21种ST型.结论 MLVA方法的分型能力不及PFGE方法,而与SBT方法分型能力相当.但是,MLVA方法操作简单、成本低廉,而且可对培养阴性的标本进行分型,因此,该方法适合在基层推广应用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵祝军	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所呼吸道传染病室	55	455	11.0	20.0
2	朱兵清	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所呼吸道传染病室	28	97	6.0	8.0
3	周海健	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所呼吸道传染病室	23	87	6.0	8.0
4	任红宇	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所呼吸道传染病室	23	127	6.0	10.0
5	关红	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所呼吸道传染病室	2	7	2.0	2.0