基于黄河鲤新品系IGF2b基因SNPs获取体系的建立及在该品系选育中的应用

• 作者: Bouzoualegh Raouf 徐跑 李欣原 梁敬东 苏胜彦 谢元澄 贺鑫晋
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黄河鲤 品系选育 IGF2b 分段克隆 SNPs 分子育种
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 686-694
• 页数: 9页
• 分类号: S917
• 字数: 5035字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2019.18306

摘要

为了建立鲤IGF2b(insulin-like growth factor 2)基因全基因组信息SNPs(single nucleotide polymorphism)的获取体系,并验证该获取体系在黄河鲤新品系选育中运用的适用性,本研究首先对10个不同鲤品种的33个鲤个体重测序数据进行分析,整体上了解IGF2b基因的单核苷酸位点及其在基因组上的分布情况.然后在基因组DNA水平上分段获取IGF2b基因的SNPs信息,并以不同的鲤品种验证引物的适用性,最后在黄河鲤新品系中检测其应用.研究结果:获得8对聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)引物进行分段克隆的结果,并通过直接测序和限制性片段长度多态性来获取相应的SNPs.经过直接测序,本文对黄河鲤、建鲤、黄河鲤和建鲤的正反交后代进行PCR检测发现条带单一,目地片段正确;结合黄河鲤新品系的体重数据,本文又以IGF2b3#引物检测到一个与体重明显相关的SNPs,同时检测到一个与该基因表达量相关的另一个SNPs.本研究的方法能够在该基因全基因组范围内开展鲤分子育种中SNPs的检测,并验证发现黄河鲤新品系IGF2b3#引物227号位点处,出现的突变位点使体重降低,且有一处SNPs与其表达量有关.这将为其他物种、其他功能基因的多态性分子标记研究提供思路.