玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的克隆及表达模式分析

• 作者: 刘玉卫 李学然 李路阳 毕欢欢 王欣宇 薛江芝 谷守芹 韩建民
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 玉米大斑病菌 MSN4 基因结构 RNA-Seq
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 页码范围: 16-20,34
• 页数: 6页
• 分类号: S432.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2019.0072

摘要

为明确玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的结构特征及其在病菌重要生长发育时期的表达模式,本试验以酿酒酵母ScMSN4氨基酸序列为探针,在玉米大斑病菌基因组数据库中搜索并克隆其同源基因,并对该基因的结构及其编码蛋白的理化性质、空间结构等进行预测;通过分析病菌关键生长发育阶段的RNA-Seq数据,明确该基因的表达模式.结果发现,在玉米大斑病菌基因组中搜索并克隆得到了ScMSN4的同源基因,将其命名为StMSN4;该基因DNA全长为1357 bp,cDNA全长为1296 bp,包含2个外显子,1个内含子;其编码蛋白包含431个氨基酸,含有2个典型ZnF-C2H2保守结构域.通过对病菌的菌丝、分生孢子、芽管、附着胞和侵入钉时等5个典型发育时期的RNA-Seq数据分析表明,StMSN4基因在5个发育时期均有表达,且表达水平较高,表明该基因在病菌的生长发育阶段发挥着重要的作用.本研究不仅明确了StMSN4基因的结构特性及其表达模式,也为深入研究该基因的功能及HOG-MAPK信号转导途径的作用机制奠定了基础.