玉米大斑病菌漆酶基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘宁 孟川 曹可可 曹志艳 董金皋 贾慧 韩建民
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 玉米大斑病菌 漆酶基因 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 页码范围: 12-18
• 页数: 7页
• 分类号: S435.131
• 语种: 中文

摘要

根据真菌漆酶铜离子结合位点的保守性,设计简并引物,利用PCR结合末端快速扩增(RACE)技术和染色体步移(Genome walking)技术获得玉米大斑病菌漆酶基因全长,采用生物信息学方法分析基因结构,预测功能.本研究共克隆获得了2个玉米大斑病菌的漆酶基因,分别命名为StLAC1和StLAC2.StLAC1基因的cDNA全长为1 806 bp,DNA全长为1 855 bp,序列含有1个49 bp的内含子,编码601个氨基酸.StLAC2基因DNA全长为1 763 bp,其中含有3个外显子,2个内含子,cDNA为1 665 bp,编码554个氨基酸.Stlac1p和Stlac2p均具有漆酶特有的3个Cu2+活性位点,且活性位点高度保守.Southern blot分析结果表明漆酶基因StLAC1和StLAC2在玉米大斑病菌基因组中均以单拷贝形式存在.结果表明:玉米大斑病菌基因组中至少存在2个漆酶基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董金皋	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	210	2521	27.0	39.0
2	曹志艳	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	38	296	9.0	16.0
3	贾慧	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	22	176	7.0	12.0
4	刘宁	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	26	73	5.0	7.0
5	孟川	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	4	7	2.0	2.0
6	曹可可	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	2	11	2.0	2.0