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摘要:
Sip毒素蛋白(secreted insecticidal protein,Sip)是苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)杀虫家族中的分泌型杀虫蛋白,对鞘翅目幼虫表现出毒性.大猿叶甲(Colaphellus bowringi)是常见的十字花科害虫,Sip蛋白对大猿叶甲具有较高的杀虫活性.本实验运用同位素相对标记与绝对定量技术(isotoperelative labeling and absolute quantification technique,iTRAQ)分析Sip蛋白处理后大猿叶甲的差异蛋白,同时对其进行功能注释、富集分析.通过ProteinpilotTM V4.5软件进行定量分析,在基因本体数据库(Gene Ontology,GO)、蛋白相邻类的聚簇数据库(Cluster of Orthologous Groups of proteins,COG)对其进行功能注释,并对其进行KEGG通路分析,同时对所有显著性差异表达蛋白进行GO及KEGG通路分析.与对照组比对后,在实验组中鉴定出具有定量信息的蛋白质47个,包含27个上调蛋白和20个下调蛋白.通过GO、COG功能注释和KEGG分析,发现这些差异蛋白主要涉及结合和催化活性等分子功能;主要参与细胞进程和代谢进程等生物过程;预测到这些差异性蛋白可能有的功能为翻译后修饰,蛋白质周转,伴侣、翻译,核糖体结构和生物合成等.通过富集分析,发现这些差异蛋白主要有核核小体、非包膜细胞器、细胞内非包膜细胞器、核小体、核糖体、COPI包膜囊泡、蛋白质-DNA复合物、分泌颗粒、核染色质、高尔基体堆等生物学功能.本研究发现,在经过Sip毒素蛋白处理后,Bt毒素常见的一些受体发生了差异性表达,如钙黏蛋白(cadherin),氨肽酶N(aminopeptidase N,APN),碱式磷酸酶(alkaline phosphatase,Alp),G蛋白(G-protein).本研究结果为Sip毒素作用机理的研究提供参考,并为Sip毒素的蛋白质组学研究提供科学参考.
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文献信息
篇名 应用iTRAQ定量蛋白质组学技术分析Sip毒素蛋白处理后的大猿叶甲差异蛋白
来源期刊 农业生物技术学报 学科 农学
关键词 大猿叶甲 Sip毒素蛋白(Sip) 同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ) 差异蛋白
年,卷(期) 2019,(10) 所属期刊栏目 研究论文与报告
研究方向 页码范围 1793-1803
页数 11页 分类号 S476.11
字数 7757字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.10.009
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 沙君雪 东北农业大学生命科学学院 3 9 2.0 3.0
2 尹彦力 东北农业大学生命科学学院 2 0 0.0 0.0
3 张悠然 东北农业大学生命科学学院 2 0 0.0 0.0
4 谭佳丽 东北农业大学生命科学学院 1 0 0.0 0.0
5 孙敬 东北农业大学生命科学学院 2 44 1.0 2.0
6 高泽平 东北农业大学生命科学学院 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
大猿叶甲
Sip毒素蛋白(Sip)
同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)
差异蛋白
研究起点
研究来源
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农业生物技术学报
月刊
1674-7968
11-3342/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
2-367
1993
chi
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