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南方农业学报期刊
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基于iTRAQ技术的水牛卵泡液蛋白质样品预处理的优化
基于iTRAQ技术的水牛卵泡液蛋白质样品预处理的优化
作者:
付强
周洁
胡炜
原文服务方:
南方农业学报
水牛卵泡液
蛋白质样品制备
沉淀剂
酶解
iTRAQ标记
优化
摘要:
[目的]优化水牛卵泡液蛋白质差异表达样品制备程序,为相对和绝对定量同位素标签(iTRAQ)技术在蛋白质差异表达分析中的应用奠定基础.[方法]在蛋白质样品溶液酶解过程中,选择两种不同沉淀剂沉淀蛋白质,分别比较蛋白质酶解、iTRAQ标记反应和多肽色谱分离的效果;在纳升液相色谱(nano-LC)分离样品前用快速分离小柱进行处理,鉴定色谱分离效果,以确定蛋白质样品预处理的优化程序.[结果]相对于丙酮,使用含0.1%乙酸的丙酮—乙醇混合液(1∶1)作为沉淀剂可获得较好的蛋白质沉淀效果,蛋白沉淀为白色,蛋白质浓度为5.76μg/μL.相对于蛋白质溶液在还原烷基化后直接使用胰蛋白酶酶解,在酶解前沉淀蛋白质溶液可使蛋白样品的酶解效率更高,获得的肽段峰更丰富、峰值更高;可使多肽和iTRAQ试剂间产生有效的标记反应,母离子具有较高的碎裂效率,获得的二级碎片峰更丰富,iTRAQ试剂的特征报告离子116 m/z较117 m/z的谱图强,辨识度高;获得的多肽nano-LC分离色谱峰更丰富,峰值和分辨率更高.相对于直接进行LC分离,在nano-LC分离前用快速分离小柱对多肽溶液进行杂质处理,也可获得丰富的多肽nano-LC色谱峰,且峰值和分辨率较高.[结论]在iTRAQ试剂标记、蛋白质液相分离和差异分析前,使用适宜的沉淀剂处理蛋白质溶液,并以快速分离小柱除去多肽混合液小分子杂质,可使质谱获得更准确的鉴定结果.
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篇名
基于iTRAQ技术的水牛卵泡液蛋白质样品预处理的优化
来源期刊
南方农业学报
学科
关键词
水牛卵泡液
蛋白质样品制备
沉淀剂
酶解
iTRAQ标记
优化
年,卷(期)
2014,(11)
所属期刊栏目
畜牧·兽医·水产·蚕桑
研究方向
页码范围
2046-2051
页数
6页
分类号
Q51
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-1191.2014.11.2046
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姓名
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1
付强
36
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5.0
8.0
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胡炜
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68
6.0
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周洁
14
62
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蛋白质样品制备
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iTRAQ标记
优化
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
总下载数(次)
0
总被引数(次)
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