西太平洋浮游有孔虫Globigerinita glutinata种内SSU rDNA多样性研究

• 作者: 李铁刚 李青霞 石峻峰 类彦立 翦知湣
• 来源期刊: 微体古生物学报
• 关键词: Globigerinita glutinata 活体浮游有孔虫 单细胞PCR 克隆技术 SSU rDNA多样性 西太平洋
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 页码范围: 12-23
• 页数: 12页
• 语种: 中文

摘要

有孔虫分子鉴定和分子多样性研究多基于SSU rDNA序列片段分析, 但某些浮游种内可能存在基因组内rDNA变化, 影响分类学和分子生态学的研究结果.为了研究浮游有孔虫物种内是否存在rDNA多样性, 本工作以采自热带西太平洋的浮游有孔虫Globigerinita glutinata活体标本作为研究对象, 经形态学鉴定后, 利用单细胞PCR和克隆技术, 获得5个虫体的20条SSU rDNA目的片段 (300-400 bp), 同时对其序列结构进行了研究.结果显示, 同种G.glutinata出现了四类不同的SSU rDNA核酸类型.序列成对分析显示, 该种遗传距离差异最长可达0.249, 远高于其它物种.此外, 同一样本不同克隆片段中, 出现了高达四个不同的SSU rDNA核酸型.序列的差异主要集中在三个不同的高变异区, 高可变区的长度范围为21 bp到63 bp.从差异序列的间隔分布推断, 核糖体基因簇的重组可能是不同SSU rDNA核酸型出现的原因.本工作在国内首次揭示了热带西太平洋浮游有孔虫G.glutinata种内的SSU rD NA核酸型, 研究结果表明G.glutinata的种内SSU rDNA变异性极大, 复杂的生活史以及假基因的存在或许是造成该现象的原因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	翦知湣		86	1169	20.0	30.0
2	李青霞		2	0	0.0	0.0
3	类彦立		2	0	0.0	0.0
4	李铁刚		2	0	0.0	0.0
5	石峻峰		2	0	0.0	0.0