GEO数据库分析环状RNA在乳腺癌组织中的表达

• 作者: 唐金海 姜林宏 张鹤达 李伟 李建 钟山亮
• 来源期刊: 中国肿瘤外科杂志
• 关键词: 乳腺癌 环状RNA miRNA 亲本基因
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 401-405
• 页数: 5页
• 字数: 3039字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-4136.2019.06.002

摘要

目的 采用生物信息学方法探究环状RNA在乳腺癌侵袭转移中的作用.方法 从GEO数据库中检索并下载乳腺癌组织的芯片数据,利用R软件对4对Luminal A型乳腺癌组织和4对三阴性乳腺癌组织进行差异分析,然后利用miRanda软件和RNAhybrid软件对差异表达的环状RNA和miRNAs之间的相互作用进行预测.通过TCGA数据库分析环状RNA的亲本基因在乳腺癌组织中的表达.结果 通过差异分析,发现共有27个环状RNA异常表达,其中6个环状RNA上调,21个环状RNA下调;通过软件预测构建了环状RNA/miRNAs相互作用网络;通过基因表达分析,hsa circ 0000965、hsa circ 0000523、hsa circ 0044234、hsa circ 0058451和hsa circ 0091994可能正向调控其亲本基因的表达.结论 在三阴性乳腺癌组织中的异常表达环状RNA将可能成为乳腺癌转移治疗的新靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李伟	东南大学内分泌科	135	939	14.0	23.0
2	钟山亮	南京医科大学附属肿瘤医院临床检验中心	6	17	2.0	4.0
3	李建	南京医科大学附属肿瘤医院普外科	38	233	8.0	14.0
4	唐金海	南京医科大学第一附属医院普外科	43	134	7.0	9.0
5	张鹤达	南京医科大学第一附属医院普外科	3	12	1.0	3.0
6	姜林宏	徐州医科大学研究生院	1	0	0.0	0.0