基于数据挖掘分析神经元正五聚体蛋白2 在肾透明细胞癌中的表达及意义

• 作者: 徐季旗 林晏廷 陈洁
• 来源期刊: 暨南大学学报（自然科学与医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 肾透明细胞癌 神经元正五聚体蛋白2 数据库分析
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 页码范围: 531-540
• 页数: 10页
• 分类号: R737.11
• 字数: 5098字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11778/j.jdxb.2019.06.009

摘要

目的:通过数据挖掘分析神经元正五聚体蛋白2(NPTX2)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及意义.方法:通过Oncomine、基因表达谱交互分析(GEPIA),以及人类蛋白质表达图谱(HPA)分别从mRNA水平和蛋白质水平上分析NPTX2在正常肾组织和ccRCC组织中的表达情况.使用GEPIA分析NPTX2与ccRCC临床分期及预后的相关性.经MethHC数据库分析NPTX2在ccRCC中的甲基化水平,利用String-DB分析NPTX2与上下游蛋白的相互作用.结果:在mRNA水平上,NPTX2在ccRCC组织中较正常肾组织显著高表达,且其表达水平与ccRCC病理分期呈正相关.TCGA数据分析结果显示,NPTX2高表达患者的总体生存率以及无病生存率明显低于低表达患者.免疫组化结果证实,NPTX2蛋白在ccRCC中也较正常肾组织高表达,且其启动子区甲基化水平明显增高.同时,NPTX2与AVP、MT-ATP6、MT-ATP8、NPAS4、RCN2等蛋白存在相互作用,并参与氧化磷酸化、ATP代谢过程等生物过程.结论:通过对肿瘤基因数据库的信息挖掘,发现NPTX2在ccRCC组织中呈高表达,且其高表达与患者预后有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈洁	暨南大学附属第一医院泌尿外科	69	318	10.0	15.0
2	徐季旗	暨南大学附属第一医院泌尿外科	2	2	1.0	1.0
3	林晏廷	暨南大学附属第一医院泌尿外科	3	1	1.0	1.0