猪主要经济性状的基因组选择研究

• 作者: 付亮亮 刘小磊 尹立林 彭潇 朱猛进 李新云 梅全顺 王海燕 赵书红
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 基因组选择 遗传力 准确性
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 439-445
• 页数: 7页
• 分类号: S114|S828.2
• 字数: 5227字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.02.023

摘要

旨在系统比较GBLUP、SSGBLUP、BayesA、BayesB、BayesC、BayesLASSO、BSLMM和BayesR等8种方法对猪重要经济性状基因组选择的准确性.本研究以本实验室收集的2 585头大白猪达100 kg日龄、达100 kg背膘厚和母猪乳头数3个性状为分析对象,结合猪50K基因芯片分型数据,以加性模型为基础,利用5倍交叉验证比较8种方法的基因组选择准确性.研究发现,基因组选择的准确性与不同性状估计遗传力呈正相关.交叉验证结果表明,预测准确性最高的性状为达100 kg日龄,但不同方法在不同性状中表现并不完全相同,在达100 kg日龄和达100 kg背膘厚中SSGBLUP基因组预测准确性均为最高,而在母猪乳头数中BayesA的基因组预测准确性最高.综上表明,对小样本开展基因组预测时,中、高等遗传力性状可以选择SSGBLUP方法,低等遗传力性状可以选择BayesA方法.如何优化和选择一种广泛适用于所有性状的方法,可能是未来研究的方向.