猪circ0001651的鉴定及其在卵泡中的表达研究

• 作者: 孙义姗 孙晓梅 李梦寻 谢苏 黄涛
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: circ0001651 母猪 组织表达谱 RNA-seq
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 53-57
• 页数: 5页
• 分类号: S828.2
• 字数: 3276字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2019-04-053

摘要

本实验旨在探究circRNA在猪卵泡发育过程中的作用,通过生物信息学分析预测其可能的调控机制,为进一步探索circRNA对卵泡发育的调控机制奠定基础.采用RNA-Seq技术对卵泡中差异性表达的circRNA进行筛选,用Real-time PCR进行组织表达谱分析,并分析其在梅山猪和杜洛克猪卵泡中的表达情况.结果 表明:circ0001651在肌肉、脂肪、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、输卵管、子宫、子宫角、垂体、下丘脑中均有不同程度表达,其中在下丘脑、垂体、输卵管、卵巢表达量相对较高;circ0001651在梅山猪M2卵泡(M2卵泡直径:5.1～7.0 mm)中的表达量极显著高于杜洛克猪(P＜0.01),在杜洛克猪M1卵泡(M1卵泡直径:3.1～5.0 mm)中的表达量极显著高于梅山猪(P＜0.01);其潜在靶基因CCR2、EGFL7、TNFRSF12A、CFL1、EGRJ、GADD45G、SLIT2等与猪的卵泡发育相关.生物信息学分析显示,circ0001651部分靶标基因参与细胞周期、细胞增殖凋亡及卵巢发育等相关信号通路,提示其可能通过对靶基因的调控作用间接参与卵泡发育过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄涛	石河子大学动物科技学院	58	197	7.0	10.0
2	谢苏	石河子大学动物科技学院	10	7	2.0	2.0
3	李梦寻	石河子大学动物科技学院	9	17	2.0	3.0
4	孙义姗	石河子大学动物科技学院	9	2	1.0	1.0
5	孙晓梅	石河子大学动物科技学院	7	12	1.0	3.0