基于生物信息学分析和预测人骨肉瘤中Gab2靶向作用的miRNA分子

• 作者: 刘纪明 吴启洋 吴龙火 张蕊 郭晓仪
• 来源期刊: 赣南医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 人骨肉瘤 生物信息学 Gab2 miRNAs 靶基因
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 肿瘤学·基础与临床
• 页码范围: 433-439,445
• 页数: 8页
• 分类号: R730.2
• 字数: 4887字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-5779.2019.05.001

摘要

目的:通过生物信息学软件分析和预测在人骨肉瘤中能够靶向结合Gab2的miRNA.方法:首先通过生物信息学软件mirWalk 2.0预测可以靶向结合Gab2的miRNA,然后用miRanda得到Gab2-miRNA的热力学稳定性评分和序列保守性评分.并通过入骨肉瘤miRNA芯片GSE70367得到在人骨肉瘤中差异表达的miRNA.在生物信息学软件打分较高的miRNA中选出差异表达的miRNA,从而选出人骨肉瘤中能与Gab2结合的特异性最强,稳定性最高的miRNA.结果:mirWalk 2.0预测有22个miRNA可与Gab2靶向结合;其中,miR-1236-3 p、miR-218-5p与Gab2结合的稳定性和特异性最好;在入骨肉瘤中差异表达的miRNA有184个,而miR-218-5p的表达也存在差异性,并且表达下调.结论:在人骨肉瘤中miR-218-5p可能靶向结合于Gab2,Gab2是miR-218-5p的靶基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴龙火	赣南医学院药学院制药工程教研室	43	160	8.0	11.0
2	张蕊	赣南医学院药学院制药工程教研室	5	6	1.0	2.0
3	吴启洋		1	0	0.0	0.0
4	刘纪明		1	0	0.0	0.0
5	郭晓仪		1	0	0.0	0.0