miR-197在慢性心力衰竭中的生物信息学分析

• 作者: 何亚州 李丽娟 梁珊 王庆高 黄彩依 黄景伟
• 来源期刊: 中西医结合心脑血管病杂志
• 关键词: 慢性心力衰竭 miRNA miR-197 生物信息学分析 靶基因 GEO数据库
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 临床医学论著
• 页码范围: 723-728
• 页数: 6页
• 分类号: R541.6|R256.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.12102/j.issn.1672-1349.2020.05.005

摘要

目的 筛选在慢性心力衰竭中差异表达的microRNA(miRNA),并对其靶基因进行生物信息学分析,以期为miRNA调控慢性心力衰竭机制的相关性研究奠定基础.方法 利用GEO数据库及limma软件包筛选出在慢性心力衰竭中差异表达的miRNA,进而应用Targetscan、miRPathDB数据库通过生物信息学方法预测其靶基因,最后利用CytoScape软件及David数据库对靶基因进行GO富集及生物通路富集分析.结果 miR-197在慢性心力衰竭中差异表达,其靶基因富集在生物调控、基因表达等生物学过程中,细胞质膜、细胞核等细胞组分上,以及离子结合、核苷酸结合等分子功能中.生物信号通路则显著富集在Ras、Rap1、Wnt、Hippo等信号通路中.结论 miR-197或许是调控慢性心力衰竭疾病进程的潜在作用靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王庆高		89	453	11.0	17.0
2	何亚州	广西中医药大学研究生院	10	8	2.0	2.0
3	梁珊	广西中医药大学研究生院	9	8	2.0	2.0
4	李丽娟	广西中医药大学研究生院	15	15	2.0	3.0
5	黄彩依	广西中医药大学研究生院	11	8	2.0	2.0
6	黄景伟	广西中医药大学研究生院	6	5	1.0	2.0