葡萄DFR蛋白的生物信息学分析及自激活检测

• 作者: 刘海霞 张鹏飞 李晓慧 杨波 温灏宇 温鹏飞
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 生物信息学 诱饵载体 酵母双杂交
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 林学与园艺
• 页码范围: 38-43
• 页数: 6页
• 分类号: S663.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13842/j.cnki.issn1671-8151.201808031

摘要

[目的]生物信息学分析葡萄DFR蛋白的功能结构域和蛋白互作预测,构建DFR酵母双杂交诱饵栽体,并检测其自激活活性.[方法]利用NCBI中的CDD分析DFR蛋白保守区域,STRING在线软件对DFR蛋白互作情况进行预测,采用PCR技术扩增出葡萄DFR基因,克隆至酵母双杂交诱饵载体pGBKT7中,PEG/LiAc法将阳性质粒pGBKT7-DFR转化至酵母AH109中,通过缺陷型培养基培养进行自激活检测.[结果]DFR蛋白保守区域有NADP结合住点,预测到DFR蛋白与MybPA1蛋白有互作关系.成功构建了诱饵载体pGBKT7-DFR,并且对酵母菌无毒性,对报告基因无自激活功能.[结论]本研究通过生物信息学分析得出,酵母诱饵蛋白表达载体pGBKT7-DFR,可以作为酵母双杂交诱饵载体筛选与DFR相互作用的蛋白,进而对其进行功能性研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	温鹏飞	山西农业大学园艺学院	56	470	12.0	20.0
3	张鹏飞	山西农业大学园艺学院	59	214	9.0	11.0
7	温灏宇	西北农林科技大学动物科技学院	3	0	0.0	0.0
8	杨波	山西农业大学园艺学院	3	0	0.0	0.0
9	刘海霞	山西农业大学园艺学院	2	0	0.0	0.0
10	李晓慧	山西农业大学园艺学院	1	0	0.0	0.0