miR-199a-3p 靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 潘晶晶 谢小娟 陈葳 魏力强
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: miR-1 99a-3p 生物信息学 mTOR GO 富集分析 KEGG Pathway 分析 膀胱癌 PI3K-Akt MAPK 蛋白聚糖
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 244-249
• 页数: 6页
• 分类号: Q74|R737.14
• 语种: 中文
• DOI: 10.7652/jdyxb201602020

摘要

目的：为深入研究 miR-199a-3p 在膀胱癌形成和发展中的作用提供理论依据。方法分析 miR-199a-3p 序列,预测其靶基因和转录因子,并对靶基因进行 GO 富集和 KEGG Pathway 分析；构建 TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图。结果miR-199a-3p 序列在多物种间具有高度保守性；GO 分析发现 miR-199a-3p 的靶基因参与细胞调节、代谢调节、细胞大分子生物合成等生物过程(P <0.01)；KEGG Pathway 分析发现 miR-199a-3p 的靶基因显著富集在上皮细胞的细菌入侵通路、ECM 受体的相互作用通路、PI3K-Akt 信号通路、MAPK 信号通路、小细胞肺癌通路、癌症中的蛋白聚糖通路等；根据构建的 TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图,挖掘出可能受 miR-199a-3p 调控的重要基因有MYC、SP1、mTOR、NFκB、NFκB1等。结论miR-199a-3p 可能通过直接靶向作用 mTOR,调节 PI3K-Akt-mTOR 信号通路,从而参与膀胱癌的形成和发展。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈葳	西安交通大学第一附属医院检验科	135	538	11.0	15.0
2	谢小娟		5	14	3.0	3.0
6	潘晶晶	西安交通大学第一附属医院检验科	4	18	3.0	4.0
7	魏力强		3	9	2.0	3.0