燕麦microRNAs及其靶基因的生物信息学预测

• 作者: 张怡晴 段娜 舒国平 贾举庆 郭红媛 陈潇洒
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: microRNA 燕麦 EST GSS 靶基因
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 428-431
• 页数: 4页
• 分类号: S512.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2014.05.02

摘要

microRNAs(miRNAs)是一类长度约22 nt的内源性非编码单链小分子RNA,通过与靶基因互补位点配对结合,在转录后水平负性调控靶基因的表达.根据miRNA在植物中的高度保守性及其前体二级结构特征,用同源预测方法将大麦、小麦、二穗短柄草等已知的植物miRNAs与燕麦表达序列标签(EST)和基因组概览序列(GSS)数据库中的非编码序列比对,采用一系列的标准进行筛选,最后预测得到46个燕麦miRNAs前体,通过在线psRNATarget检索共预测到61个靶基因.结果表明,通过生物信息学方法大大提高了发现miRNAs及其靶基因的效率,补充了燕麦miRNA数据库的不足.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭红媛	山西农业大学农学院	12	44	4.0	6.0
2	贾举庆	山西农业大学农学院	10	28	3.0	5.0
3	段娜	山西农业大学农学院	1	1	1.0	1.0
4	张怡晴	山西农业大学农学院	1	1	1.0	1.0
5	舒国平	山西农业大学农学院	1	1	1.0	1.0
6	陈潇洒	山西农业大学农学院	1	1	1.0	1.0