Hsa-miR-10a-5p靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 曾怀才 陈聪 陈鸿儒
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: miR-10a-5p 靶基因预测 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 189-194
• 页数: 6页
• 分类号: Q343.1
• 字数: 3137字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201903010

摘要

利用生物信息学对miR-10a-5p的靶基因进行预测及相关分析,为miR-10a-5p靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础.通过miRBase获取并分析人、大鼠,小鼠等物种的miR-10a-5p的碱基序列特征;使用在线数据库Targetscan7.1,miRDB,mirDIP和DIANA TOOLS等预测miR-10a-5p的靶基因,并用Venny 2.1绘制韦恩图取交集.用在线工具DAVID对交集靶基因进行GO功能注释和KEGG pathway分析.结果表明miR-10a-5p成熟序列在各物种间高度保守.获得的79个靶基因在分子功能上主要涉及染色质结合,转录活性激活等,并显著富集于肝脏发育,脂肪组织发育等生物学过程,涉及cAMP信号通路,TNF信号通路及AMPK信号通路.miR-10a-5p通过调控靶基因参与了生命活动和疾病过程中多个方面,尤其生长发育和癌症过程,为进一步研究提供了生物学基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾怀才	南华大学公共卫生学院预防医学系	39	148	7.0	10.0
2	陈聪	南华大学公共卫生学院预防医学系	8	8	2.0	2.0
3	陈鸿儒	南华大学公共卫生学院预防医学系	1	1	1.0	1.0