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生物信息学
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China Journal of Bioinformatics
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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物，报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位：
哈尔滨工业大学
ISSN：
1672-5565
CN：
23-1513/Q
出版周期：
季刊
邮编：
150001
地址：
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 蛋白质结构从头预测是不依赖模板仅从氨基酸序列信息得到天然结构.它的关键是正确定义能量函数、精确选用计算机搜索算法来寻找能量最低值.基于此,本文系统介绍了能量函数和构象搜索策略,并列举了几种比...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 人类基因组Y染色体回文序列具有非常特殊的对称结构,容纳了许多控制着睾丸发育的基因,破译其结构与所隐含的遗传信息成为生物信息学家们的机遇和挑战.利用语言学中Zipf定律的方法分析了Y染色体八个...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 利用PCR-SSCP方法检测了CRP基因在中国荷斯坦奶牛群体中的单核苷酸多态性,并用各种网络分析软件分析了单核苷酸改变对其功能的影响.结果表明:CRP基因在P1引物扩增片段中存在PCR-SS...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 针对小型实验室特点和实际需要,提出并实现一个以服务器-客户机模式,涵盖web服务,生物序列分析,生物芯片数据分析,实验数据统计处理,文献服务等计算机辅助的通用解决方案.该解决方案已经应用在批...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 通过枢纽蛋白与其互作邻居之间的共表达关系在从前列腺正常组织到原位癌及原位癌到转移的两个发展阶段的变化,寻找在前列腺癌发生和发展过程中动态改变的枢纽蛋白,为探讨前列腺癌的发病与转移机理提供线索...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 用电子克隆方法获得甘蔗MYB2基因,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析.结果表明:甘蔗...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 害虫发生量与其影响因子之间具有复杂的非线性和时滞性关系,传统方法不能很好的分析和拟合高度非线性的害虫发生量变化规律,导致预测精度不理想.为了有效构建害虫发生量与其影响因子之间复杂的非线性关系...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 根据NCBI数据库中基因ORF)的数目,分析了开阅读框架的数目随长度的分布关系,结果发现有明显的规律性.根据分布的特点用各种分布模型进行拟合比较,提出这类分布是Г(α,β)分布的假设.进一步...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 以葡萄中的蔗糖转运蛋白为主要研究对象,结合了功能研究较为深入的拟南芥和水稻蔗糖转运蛋白家族序列,分析讨论了这些基因在启动子区域顺式作用元件的异同,以及这些差异可能对mRNA的转录带来的影响;...
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10. 探讨生物信息标准化研究刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 针对生物信息在国内的发展现状,提出研制生物信息标准的需求.首先从生物数据资源收集、管理规范入手,在此基础上进行了生物信息资源管理体系的研究,最后讨论了共享交流软件系统的开发和生物信息数据挖掘...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 依据蛋白质折叠子中氨基酸保守性,以氨基酸、氨基酸的极性、氨基酸的电性以及氨基酸的亲-疏水性为参数,从蛋白质的氨基酸序列出发,采用"一对多"的分类策略,通过构建打分矩阵和选取氨基酸序列模式片断...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 根据生理组学多领域多层次协同研究的需求,针对中国生理组学研究的特点,设计了一种跨层次建模标记语言(Multiscale Modeling Markup Language,简称M3L),规范研...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 分别用PCR方法扩增了1.7kbp和1.6kbp的猪PSP-Ⅰ和PSP-Ⅱ基因的启动子,并进行TA克隆,测序鉴定,测序结果用DNAstar程序与Genebank中的相应序列进行对比分析,结果...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 以GenBank公开的甲型流感病毒亚型的血凝素(hemagglutinin,HA)核苷酸序列为材料,从简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分布的分析角度出发,...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 对链球菌属纤连蛋白结合蛋白进行系统的分析,找出其特征,为以后的研究奠定基础.通过MUSCLE、BLASTP、PSI-BLAST、PHYLIP、Perl编程等生物信息学方法对217条候选纤连蛋...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 随着分子生物信息数据量高速增长,生物信息学面临着大规模、高通量、密集型计算的巨大挑战.为有效利用计算机资源,缩短高通量生物信息计算程序执行时间,我们基于Globus Toolkit 网格中间...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 采用复杂网络理论分析了人代谢网络的巨强连通体.通过对高质量人代谢网络数据的整理,获取了该网络巨强连通体中的所有代谢反应.用代谢物图表示这些反应形成了一个网络,它包含了256个节点和648条连...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： EDNRB/EDN3/ECE-1信号传导通路在胚胎发育期神经嵴细胞分化、迁移、发育为神经节细胞的过程中起到关键作用.采用进化足迹法,利用生物信息学在线软件分析先天性巨结肠相关EDNRB基因启...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 阳离子-π相互作用是一种在阳离子和芳香性体系之间形成的一种作用力.在蛋白质中,带正电荷的氨基酸(Lys、Arg)和芳香族氨基酸(Phe、Tyr、Trp)之间可以形成阳离子-π相互作用.对α/...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN–LIKE (SBP) 转录因子家族是植物特有的一类转录因子.本文确定了20水稻基因组上编码的SBP基因.通过分类,染色体定...
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21. 基于密码对使用的基因组进化刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年1期页码:摘要： 以密码对使用偏好性和密码对中二核苷酸频率分别构建了系统发育树.发现用 40 种模式生物编码序列中密码对的二核苷酸频率构建的系统发育树,明显将生物按进化分成细菌,古菌,真核生物;用密码对使用偏...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年2期页码:摘要： 为了建立基于EBI数据库的本地SRS服务系统,进而为生物医学研究人员提供方便、快速搜索EBI常用生物数据库的web服务,同时提供一套技术机制为其他生物医学研究机构建设自己的SRS服务系统提供...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年2期页码:摘要： 用时间序列模型来分析乙型、丙型这两种流感病毒,对乙流、丙流病毒DNA序列提供了一种新的时间序列模型,即CGR弧度序列.利用CGR坐标将乙流、丙流病毒DNA序列转换成CGR弧度序列,且引入长记...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年2期页码:摘要： DNA甲基化是影响基因表达的重要因素之一.DNA甲基化芯片已广泛应用于寻找癌症的标志物,但是目前还没有研究对这些标志物的重复性进行评价.另外,DNA甲基化对基因表达的影响也存在争议.在本文中...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年2期页码:摘要： 新一代测序平台的诞生推动了对全基因组鸟枪法测序数据的拼接算法和软件的研究,自2005年以来多种用于高通量测序的序列拼接软件已经被开发出来,并且在不断地进行改进以提高拼接效果.本文利用目前广泛...
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26. 生物网络研究进展述评刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年2期页码:摘要： 生物网络是一类典型的复杂适应性系统,包含了许多个体的多层次的各种相互作用和关系,在过去的十年里,利用复杂网络理论对生物网络进行研究引起了人们的注意并获得了快速发展.本文首先从从度分布、聚类系...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年2期页码:摘要： 识别真核基因的转录因子结合位点(或称模体)是后基因组时代的一项主要工作,对共表达或共调控的基因同时进行分析可以提高模体识别的准确性.本文基于2×2列联表的对数线性模型,以模体出现的基因条数计...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年2期页码:摘要： 利用高粱EST数据库及电子克隆等技术克隆了高粱APX基因,其开放阅读框大小为753bp,编码250个氨基酸残基,推导的蛋白质分子量为27.1kDa,等电点约为5.135.它与C4植物玉米的胞...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年2期页码:摘要： 根据木糖还原酶基因序列相似的特点,设计一对引物获得Pichia stipitis CICC1960的一段基因片段,此片段长度为957bp,共编码318个氨基酸.利用生物信息学软件对该序列进行...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2011年2期页码:摘要： 细胞色素P450 BM3作为烷烃羟基化酶,能催化正链烷烃,已被广发研究和应用.利用动力学模拟软件对BM3酶与烷烃底物复合物进行构象、酶的活性位点以及结合能的预测,并通过模拟水以及离子环境下对...
生物信息学基本信息
| 刊名 | 生物信息学 | 主编 | 任南琪 |
| 曾用名 | |||
| 主办单位 | 哈尔滨工业大学 | 主管单位 | 中华人民共和国工业和信息化部 |
| 出版周期 | 季刊 | 语种 |
chi
|
| ISSN | 1672-5565 | CN | 23-1513/Q |
| 邮编 | 150001 | 电子邮箱 | itgene@sohu.com |
| 电话 | 0451-86414135；0451-86417711（吴永英） | 网址 | http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx |
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