生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

CSTPCD

影响因子 0.3945
本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 李江域 毛逸清 王小磊 赵东升
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  93-96
    摘要: 为了建立基于EBI数据库的本地SRS服务系统,进而为生物医学研究人员提供方便、快速搜索EBI常用生物数据库的web服务,同时提供一套技术机制为其他生物医学研究机构建设自己的SRS服务系统提供...
  • 作者: 刘娟 高洁
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  97-101
    摘要: 用时间序列模型来分析乙型、丙型这两种流感病毒,对乙流、丙流病毒DNA序列提供了一种新的时间序列模型,即CGR弧度序列.利用CGR坐标将乙流、丙流病毒DNA序列转换成CGR弧度序列,且引入长记...
  • 作者: 姚晨 李红东 郭政
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  102-105
    摘要: DNA甲基化是影响基因表达的重要因素之一.DNA甲基化芯片已广泛应用于寻找癌症的标志物,但是目前还没有研究对这些标志物的重复性进行评价.另外,DNA甲基化对基因表达的影响也存在争议.在本文中...
  • 作者: 姜焕焕 安小平 朱大强 李存 江晓芳 童贻刚 米志强 陈斌 陈禹保
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  106-112
    摘要: 新一代测序平台的诞生推动了对全基因组鸟枪法测序数据的拼接算法和软件的研究,自2005年以来多种用于高通量测序的序列拼接软件已经被开发出来,并且在不断地进行改进以提高拼接效果.本文利用目前广泛...
  • 作者: 郭进利 高蕾
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  113-119
    摘要: 生物网络是一类典型的复杂适应性系统,包含了许多个体的多层次的各种相互作用和关系,在过去的十年里,利用复杂网络理论对生物网络进行研究引起了人们的注意并获得了快速发展.本文首先从从度分布、聚类系...
  • 作者: 周荣阁 张静
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  120-124,130
    摘要: 识别真核基因的转录因子结合位点(或称模体)是后基因组时代的一项主要工作,对共表达或共调控的基因同时进行分析可以提高模体识别的准确性.本文基于2×2列联表的对数线性模型,以模体出现的基因条数计...
  • 作者: 刘李黎 孟鹏 王萍 陈刚 陈国强
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  125-130
    摘要: 利用高粱EST数据库及电子克隆等技术克隆了高粱APX基因,其开放阅读框大小为753bp,编码250个氨基酸残基,推导的蛋白质分子量为27.1kDa,等电点约为5.135.它与C4植物玉米的胞...
  • 作者: 孙博 葛菁萍
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  131-133,137
    摘要: 根据木糖还原酶基因序列相似的特点,设计一对引物获得Pichia stipitis CICC1960的一段基因片段,此片段长度为957bp,共编码318个氨基酸.利用生物信息学软件对该序列进行...
  • 作者: 姚学峰 宋怡铃
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  134-137
    摘要: 细胞色素P450 BM3作为烷烃羟基化酶,能催化正链烷烃,已被广发研究和应用.利用动力学模拟软件对BM3酶与烷烃底物复合物进行构象、酶的活性位点以及结合能的预测,并通过模拟水以及离子环境下对...
  • 作者: 吴青 张伟丽 甄一松 肖成路
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  138-141,145
    摘要: R是用于统计计算和数据作图的编程语言和程序设计环境,能在多种平台下编译和运行.Bioconductor也是免费开源的程序设计环境,它主要基于统计编程语言R,用于基因组数据的分析.我们通过已发...
  • 作者: 张天驰 张菁
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  142-145
    摘要: 蛋白质折叠过程模拟是当前蛋白质研究领域的一个难点问题.针对这一问题,提出了一个描述蛋白质折叠过程的算法一拟蛇算法,并且从分子振荡和分子动力学理论两个方面来证明该算法的核心函数是可行和正确的....
  • 作者: 张林 柴惠 沃立科 袁小凤 黄燕芬
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  146-150,154
    摘要: 生物序列比对是生物信息学的基础,是当今功能基因组学研究中最常用、最重要的研究方法之一.本文对各类序列比对算法优缺点进行分析,对图形硬件的优势进行挖掘.在此基础上,将各类序列比对算法中准确性最...
  • 作者: 孙一桐 张晶 沈玉琳 金能智
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  151-154
    摘要: 解读人类和黑猩猩之间的差异性对于研究人类的进化历史具有非常重要的意义.人类和黑猩猩Y染色体相继测序完毕,利用dot-plot程序可以分析它们之间的差异性.研究结果显示,人类和黑猩猩MSY区在...
  • 作者: 尤萍 曾照芳 李明强
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  155-156,163
    摘要: 通过阻塞大鼠大脑动脉,制备短暂性脑缺血大鼠模型,将出现神经功能缺失症状的大鼠随机分组,实施再灌注后立即(40mg/kg)进行腹腔注射人参皂甙Rb1.结果发现大鼠脑缺血再灌注后,人参皂甙Rb1...
  • 作者: 晁江涛 马春森
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  157-163
    摘要: RNA二级结构的预测算法研究已有近40年的发展历程,研究假结也将近30年的历史.在此期间,RNA二级结构的预测算法取得了很大进步,但假结预测的正确率依然偏低.其中启发式算法能较好地处理复杂假...
  • 作者: 王年 王蕊平 苏亮亮 陈乐
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  164-166,170
    摘要: 海量数据的存在是现代信息社会的一大特点,如何在成千上万的基因中有效地选出样本的分类特征对癌症的诊治具有重要意义.采用局部非负矩阵分解方法对癌症基因表达谱数据进行特征提取.首先对基因表达谱数据...
  • 作者: 吕强 杨凌云
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  167-170
    摘要: 蛋白质小分子对接的难点之一是从生成的大量候选结构中挑选出近天然构象.本文使用了一种基于SVR的方法来挑选RosettaLigand生成的GPCR-配体decoy构象中的近天然构象.首先,对已...
  • 作者: 刘太岗 王伟 王军 窦永超 赵娟 郑小琪
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  171-175,180
    摘要: 蛋白质的亚细胞位点信息有助于我们了解蛋白质的功能以及它们之间的相互作用,同时还可以为新药物的研发提供帮助.目前普遍采用的亚细胞位点预测方法主要是基于N端分选信号或氨基酸组分特征,但研究表明,...
  • 作者: 盛德乔
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2011年2期
    页码:  176-180
    摘要: Deeaf1在小鼠体内可调控约600个基因的表达.用Clover程序对受Deaf1调控的基因的启动子区进行分析,结果发现受DEAF1调控的基因中约半数(263/590)含有能被DEAF1结合...

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
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