生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 刀福英 林昊 陈欣欣
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年1期
    页码:  1-6
    摘要: 嗜热蛋白在高温下能保持稳定性和活性,是研究蛋白质热稳定性的理想模型,开发一个蛋白质热稳定性识别的方法将对蛋白质工程和蛋白质的设计很有帮助.目前的研究中,氨基酸的组成及其物化性质一直被认为和蛋...
  • 作者: 冯瑞云 刘江娜 张爱萍 张维锋 张西英 白云凤 贺飞燕 闫建俊
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年1期
    页码:  7-15
    摘要: 番茄为呼吸跃变型果实,伴随呼吸跃变产生大量乙烯,即系统II乙烯,易使番茄果实过熟,导致腐烂变质.SlACS2是番茄系统II乙烯合成的限速酶,通过CRISPR-Cas9基因组编辑系统修饰该基因...
  • 作者: 林娟 洪晓昆 谢勇 鄢仁祥
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年1期
    页码:  16-26
    摘要: 利用生物信息学软件和数据库对从Microbulbifer sp.BN中得到的琼胶酶rAgaN3全长基因进行预测分析,结果表明:重组琼胶酶 rAgaN3理论分子量为31.243 kDa,理论等...
  • 作者: 廖东庆 李晓明 韦旭钦 黄日波
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年1期
    页码:  27-32
    摘要: 普鲁兰酶(Pullulanase)是脱支酶,因其能水解葡聚糖的α-1,6-糖苷键而有不同的工业应用潜力.本研究通过同源建模和分子对接的方法对长野芽孢杆菌(Bacillus naganoens...
  • 作者: 南蓬 徐康萍 裘锋 魏冬凯
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年1期
    页码:  33-45
    摘要: RRBS(简化甲基化测序)是一种有效研究DNA甲基化状态的测序方案.文库构建是该方案中最关键的实验步骤之一,RRBS文库构建往往因为酶切产物少,文库构建步骤繁多等因素,导致DNA起始量需要1...
  • 作者: 王耘 赵媛媛
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年1期
    页码:  46-54
    摘要: 组合药物在复杂疾病的治疗中形成了多靶点,多环节上的密切联系,对疾病的治疗效果也可达到单种药物治疗意想不到的效果.组合药物中各单药功能各异但联用后治疗效果更佳,说明所对应疾病之间可能存在某种关...
  • 作者: 刘立伟 刘铁晖
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年1期
    页码:  55-58
    摘要: 本研究提出了一种新的RNA二级结构的图形表示方法,这种方法不同于以往的表示方式.根据所提出的RNA二级结构的图形表示,将对9种病毒的RNA二级结构进行图形表示,构建系统进化树,进行序列间相似...
  • 作者: 金能智 陆会宁 齐燕姣
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年1期
    页码:  59-68
    摘要: 莪术醇是近年来发现的重要的新的抗肿瘤中药单体之一.分析莪术醇与转运蛋白-血清白蛋白之间的相互作用能够帮助研究者更好的理解药物的作用机制.本文通过用多序列分析、进化关系和分子对接技术等分析莪术...
  • 作者: 宋德平 谌南辉
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  69-77
    摘要: 旨在生命机体与危险因子间建立生命物质信息对话平台,以物质化的信息,或信息化的物质的思维进行理解和推论,建立物质承载信息,信息通过物质的形式传递的思维模式,对生命信息中危险因子的属性、分类以及...
  • 作者: 张业晓 李晓琴
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  78-83
    摘要: 蛋白质折叠规律研究是生命科学领域重要的前沿课题之一,蛋白质折叠类型分类是折叠规律研究的基础.本研究以SCOP数据库的蛋白质折叠类型分类为基础、以Astral SCOPe 2.05数据库中相似...
  • 作者: 孙廷凯 沈乐阳
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  84-89
    摘要: 在机器学习问题中,类别不平衡问题严重影响一些标准分类器的性能.因此,解决类别不平衡问题尤为重要.上采样是解决类不平衡问题的常用方法,其通过合成新的少数类样本来平衡类的分布.在文中,使用一种基...
  • 作者: 刘冠宏 孙玉娜 宋有涛 张桥石 薛友林
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  90-96
    摘要: Ydj1p是酵母细胞质中一种主要的Ⅰ型Hsp40分子伴侣,Ydj1p锌指结构在传递底物给Hsp70时发挥重要的作用,锌指结构域的两个锌离子结合位点区域(ZBD Ⅰ和ZBDⅡ)与半胱氨酸形成配...
  • 作者: 张旭 马聿迪
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  97-104
    摘要: 禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)是引起小麦赤霉病的主要致病菌.G蛋白偶联受体(G protein coupled receptors,GPCRs)是一类重要的细胞表面受...
  • 作者: 郭雨珍 陶凤英
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  105-111
    摘要: 本文在菱形网格上研究讨论了二维HP模型.首先,将蛋白质结构预测问题转化成一个数学问题,并简化成氨基酸序列中每个氨基酸与网格格点的匹配问题.为了解决这个数学问题,我们改进并扩展了经典的粒子群算...
  • 作者: 向春杰 杨博超 者建武 金能智 齐燕姣
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  112-119
    摘要: 槲皮素类化合物是众多黄酮类中活性最高的化合物之一,在医药方面有很强的药效功效.本研究选取两种槲皮素类黄酮化合物异鼠李素和异鼠李素-3-O-葡萄糖苷作为目标化合物,运用Gaussian 09软...
  • 作者: 刘建 姜亚斌 邹任玲
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  120-126
    摘要: 肌肉在周期的收缩或静态的拉伸过程中,会渐渐进入疲劳状态,肌肉疲劳特性的研究在康复医学、运动医学领域具有重要作用.表面肌电信号是从肌肉表面通过电极记录下来的反映神经肌肉系统活动的一维时间序列非...
  • 作者: 王敬敬 赵维 黄志勇
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  127-133
    摘要: 探针设计是制备高质量基因芯片的重中之重.ARB软件是用于设计系统发育芯片(PhyloChip)探针的主要软件,然而由于安装困难、相关中文文章较少等原因,阻碍了其在国内的广泛使用.本文详细介绍...
  • 作者: 王振宇 王路 田庆彬 程翠林
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年2期
    页码:  134-136
    摘要: 生物分离工程是高等学校生物工程专业的基础课程,与生产实践密切相关.教学过程中采用参与式教学方法能够培养学生工程设计的创造性思维,并且提高学生的工程化能力.本研究从科研融入教学、开展课堂讨论、...
  • 作者: 刘亚军 刘宏德 孙啸 张峰 谢建明
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  137-141
    摘要: 染色质高级结构是基因转录调节的重要因素,染色质多重相互作用是高级结构中的一种,是多个(≥3)染色质片段在空间上相互接触而形成的紧凑结构.为了解染色质多重相互作用这类高级结构的特征及其在干细胞...
  • 作者: 吕强 王帅 蔡磊鑫 顾倜
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  142-148
    摘要: 假结是RNA中一种重要的结构,由于建模的困难导致它更难被预测.通过碱基之间的配对概率来预测含假结RNA二级结构的ProbKnot算法具有很高的精度,但该算法仅用了配对概率作为预测依据,导致阴...
  • 作者: 刘华英 李少梅 李惠敏 秦新民 罗琼 肖君
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  149-155
    摘要: 为探讨沙田柚自交不亲和性的机理,利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚RING?H2 finger基因序列.采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序...
  • 作者: 尹丽 徐存拴
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  156-163
    摘要: 自噬对肝再生有积极的作用,但具体作用机制仍有待阐明.为了解自噬在大鼠肝再生的变化和机理,通过蛋白质组学(iTRAQ方法)检测了大鼠肝再生中调控自噬的信号通路相关蛋白和自噬过程相关蛋白的变化....
  • 作者: 刘毅慧 吴冠朋 黄伟
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  164-170
    摘要: 为了建立乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)再激活的预测模型,提出CART(classification and regression tree)特征选择方法应用在原发...
  • 作者: 者建武 赵志威 金能智 齐燕姣
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  171-178
    摘要: 用生物信息学的方法分析不同物种的血清白蛋白的亲缘关系,分析降血糖药物米格列醇和伏格列波糖与人血清白蛋白相互作用位点在其他亲缘关系较近的物种中相应的氨基酸变化特点.结果表明米格列醇、伏格列波糖...
  • 作者: 周雪松 李晓 李达 赵勇
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  179-185
    摘要: 在药物研发早期阶段对化合物成药性和安全性进行评估,对于提高药物研发成功率、降低研发成本具有十分重要的意义.为了能够帮助药物研究工作者快速准确地判断候选化合物的成药性与安全性,开发了一个基于计...
  • 作者: 刘建 姜亚斌 徐秀林 胡秀枋 邹任玲
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  186-190
    摘要: 脑卒中患者康复治疗中会引起下肢肌肉痉挛,这种现象给患者的康复训练过程带来极大的危害,因此能够在训练过程中识别痉挛并及时中断训练具有重要的实际意义.本研究通对下肢表面肌电信号的采集,采用基于形...
  • 作者: 喻洪流 曹武警 李瑨 赵伟亮 魏小东
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  191-195
    摘要: 为研究当前主动型下肢假肢控制问题的解决策略,提出了主动型下肢假肢设计和分类的通用控制框架,包括3个分层结构:上层控制器、中层控制器、底层控制器.其中,上层控制器感知运动意图;中层控制器将运动...
  • 作者: 吴丹丹 孙昌 王永安 阮伋
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年3期
    页码:  196-200
    摘要: 尽管二代基因组测序技术日渐流行,Sanger测序依旧是SNP识别和分析的金标准.传统对于Sanger测序结果的分析多依赖SeqMan等软件进行.然而这类软件大多依靠人工操作来识别和记录测序结...
  • 作者: 宋成义 沈丹 王伟 钟继汉 钱跃 陈伟 陈才 高波
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年4期
    页码:  201-206
    摘要: 转座子是基因组中可移动和扩展的元件,能够插入新的位点,影响基因组和基因的结构和功能,是基因组进化的内在驱动.为探讨转座子的时空表达特性,首先通过生物信息学方法鉴定出斑马鱼9个疑似活性转座子,...
  • 作者: 孙兆贵 张瑜
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2017年4期
    页码:  207-213
    摘要: 泛素羧基末端水解酶-1(ubiquitin C-terminal hydrolase L1,UCHL1)是一种去泛素化酶,特异性表达于脑与生殖腺,具有去泛素化活性、稳定细胞内泛素单体的功能....

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
地址 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼

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