沙田柚RING?H2 finger基因的生物信息学分析

• 作者: 刘华英 李少梅 李惠敏 秦新民 罗琼 肖君
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: 沙田柚 RING?H2finger蛋白基因 生物信息学 环指结构域
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 149-155
• 页数: 7页
• 分类号: S576
• 字数: 3503字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.201701005

摘要

为探讨沙田柚自交不亲和性的机理,利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚RING?H2 finger基因序列.采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构以及功能域等方面进行了预测和分析.结果表明:该基因全长为845 bp,开放阅读框(ORF)全长为387 bp,编码128个氨基酸,编码蛋白质的分子量为13.61 KDa,理论等电点为4.26;该蛋白质含有一个植物RING?H2 finger蛋白家族的保守结构域,为疏水性不稳定蛋白.氨基酸序列分析表明,其编码的氨基酸与甜橙(Cs4g15340.1)RING?H2 finger蛋白的相似度为98%.这些分析结果可为今后深入研究该蛋白的结构特征和功能提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦新民	广西师范大学生命科学学院	74	526	13.0	17.0
2	刘华英	广西师范大学生命科学学院	23	74	5.0	8.0
3	李惠敏	广西师范大学生命科学学院	35	250	10.0	15.0
4	罗琼	广西师范大学生命科学学院	4	0	0.0	0.0
5	肖君	广西师范大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
6	李少梅	广西师范大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0